# electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)
#   - a module of PHENIX version dev-svn-
#   - file written: Tue Mar 17 12:24:24 2020
#   Inital geometry file: a 53 line input string
#   Ligand name: 4-phenyl-1,2,3-thiadiazol-5-amine
#   Quantum optimisation: True
#   Method: PBEh-3c
#   Random seed: 3628800
#   SMILES string: Nc1snnc1c2ccccc2
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
_chem_comp.initial_date
_chem_comp.modified_date
_chem_comp.source
 0DQ  0DQ  4-phenyl-1,2,3-thiadiazol-5-amine  ligand  19  12  .  2021-08-03  2021-08-03  
;
Directly from eLBOW using geometry from QM method PBEh-3c with CPCM solvent model
Validated by Mogul as PERFECT
;

data_comp_0DQ
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 0DQ  N25  N  NH2   0  -0.814   1.1972   2.0942  -0.4280
 0DQ  C26  C  CR5   0  -0.011   1.4308   0.7965  -0.1598
 0DQ  C27  C  CR5   0   0.197   0.5164  -0.2271   0.0763
 0DQ  N28  N  N     0  -0.220   1.1146  -1.4151   0.3193
 0DQ  N29  N  N     0  -0.362   2.3765  -1.4309   0.3150
 0DQ  S30  S  S2    0   0.360   2.9948   0.1221  -0.0244
 0DQ  C31  C  CR6   0   0.090  -0.9462  -0.1287   0.0523
 0DQ  C32  C  CR16  0  -0.292  -1.7089  -1.1866  -0.4495
 0DQ  C33  C  CR16  0  -0.240  -3.0925  -1.1119  -0.4696
 0DQ  C34  C  CR16  0  -0.265  -3.7418   0.0219   0.0045
 0DQ  C35  C  CR16  0  -0.236  -2.9937   1.0750   0.5108
 0DQ  C36  C  CR16  0  -0.331  -1.6079   0.9990   0.5417
 0DQ  H25  H  HNH2  0   0.413   0.2827   2.3466  -0.7689
 0DQ  H26  H  HCR6  0   0.255  -1.2139  -2.0691  -0.8334
 0DQ  H27  H  HCR6  0   0.259  -3.6657  -1.9409  -0.8641
 0DQ  H28  H  HCR6  0   0.259  -4.8221   0.0809  -0.0174
 0DQ  H29  H  HCR6  0   0.261  -3.4870   1.9577   0.8962
 0DQ  H30  H  HCR6  0   0.261  -1.0482   1.8168   0.9780
 0DQ  H2   H  HNH2  0   0.415   1.9422   2.6610  -0.7978

loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
_chem_comp_bond.value_dist_neutron
 0DQ  C35  C36  aromatic  1.388  0.020  1.388
 0DQ  C35  C34  aromatic  1.387  0.020  1.387
 0DQ  C36  C31  aromatic  1.396  0.020  1.396
 0DQ  N28  N29  aromatic  1.262  0.020  1.262
 0DQ  N28  C27  aromatic  1.352  0.020  1.352
 0DQ  N29  S30  aromatic  1.706  0.020  1.706
 0DQ  C34  C33  aromatic  1.390  0.020  1.390
 0DQ  C31  C27  single    1.466  0.020  1.466
 0DQ  C31  C32  aromatic  1.397  0.020  1.397
 0DQ  C27  C26  aromatic  1.393  0.020  1.393
 0DQ  C33  C32  aromatic  1.386  0.020  1.386
 0DQ  S30  C26  aromatic  1.709  0.020  1.709
 0DQ  C26  N25  single    1.345  0.020  1.345
 0DQ  N25  H25  single    0.890  0.020  1.040
 0DQ  C32  H26  single    0.930  0.020  1.080
 0DQ  C33  H27  single    0.930  0.020  1.080
 0DQ  C34  H28  single    0.930  0.020  1.080
 0DQ  C35  H29  single    0.930  0.020  1.080
 0DQ  C36  H30  single    0.930  0.020  1.080
 0DQ  N25  H2   single    0.890  0.020  1.040

loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 0DQ  H2   N25  H25  113.97  3.000
 0DQ  H2   N25  C26  119.20  3.000
 0DQ  H25  N25  C26  117.80  3.000
 0DQ  S30  C26  C27  107.30  3.000
 0DQ  S30  C26  N25  123.74  3.000
 0DQ  C27  C26  N25  128.95  3.000
 0DQ  C31  C27  N28  120.22  3.000
 0DQ  C31  C27  C26  127.08  3.000
 0DQ  N28  C27  C26  112.69  3.000
 0DQ  N29  N28  C27  116.92  3.000
 0DQ  S30  N29  N28  110.60  3.000
 0DQ  N29  S30  C26   92.48  3.000
 0DQ  C36  C31  C32  118.60  3.000
 0DQ  C32  C31  C27  119.97  3.000
 0DQ  C36  C31  C27  121.42  3.000
 0DQ  H26  C32  C33  119.70  3.000
 0DQ  H26  C32  C31  119.67  3.000
 0DQ  C33  C32  C31  120.62  3.000
 0DQ  H27  C33  C34  120.11  3.000
 0DQ  H27  C33  C32  119.53  3.000
 0DQ  C34  C33  C32  120.36  3.000
 0DQ  H28  C34  C35  120.28  3.000
 0DQ  H28  C34  C33  120.26  3.000
 0DQ  C35  C34  C33  119.46  3.000
 0DQ  H29  C35  C36  119.46  3.000
 0DQ  H29  C35  C34  120.22  3.000
 0DQ  C36  C35  C34  120.32  3.000
 0DQ  H30  C36  C35  118.93  3.000
 0DQ  H30  C36  C31  120.42  3.000
 0DQ  C35  C36  C31  120.64  3.000

loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 0DQ  CONST_01  N29  N28  C27  C26    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_04  N28  N29  S30  C26    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_05  S30  N29  N28  C27    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_06  C35  C36  C31  C27  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_07  C33  C32  C31  C27  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_08  N29  S30  C26  C27    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_11  S30  C26  C27  N28    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_12  C31  C27  N28  N29  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_13  C31  C27  C26  S30  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_14  C34  C35  C36  C31    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_15  C34  C33  C32  C31    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_16  C35  C36  C31  C32    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_17  C35  C34  C33  C32    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_18  C36  C35  C34  C33    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_19  C36  C31  C32  C33    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_20  N28  C27  C26  N25  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_21  C31  C27  C26  N25    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_22  N29  S30  C26  N25  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_23  H30  C36  C31  C27    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_24  H26  C32  C31  C27    0.00  0.0  0
 0DQ  CONST_25  H29  C35  C36  C31  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_26  H27  C33  C32  C31  180.00  0.0  0
 0DQ  CONST_27  H28  C34  C33  C32  180.00  0.0  0

loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 0DQ  plan-1  N25  0.020
 0DQ  plan-1  C26  0.020
 0DQ  plan-1  C27  0.020
 0DQ  plan-1  N28  0.020
 0DQ  plan-1  N29  0.020
 0DQ  plan-1  S30  0.020
 0DQ  plan-1  C31  0.020
 0DQ  plan-2  C27  0.020
 0DQ  plan-2  C31  0.020
 0DQ  plan-2  C32  0.020
 0DQ  plan-2  C33  0.020
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 0DQ  plan-3  N25  0.020
 0DQ  plan-3  C26  0.020
 0DQ  plan-3  H25  0.020
 0DQ  plan-3  H2   0.020

