    1    1  301
db4.dat
      ALANINE COO- ANION
ALA
 ALA  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C3    E    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
   9  O     O2    E    8   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  10  OXT   O2    E    8   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

DONE
     GLYCINE COO- ANION
GLY
 GLY  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CQ    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  C     C     M    6   4   3     1.522   110.400   180.000   0.70000
   8  O     O2    E    7   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
   9  OXT   O2    E    7   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CA   OXT  C    O

DONE
     SERINE COO- ANION
SER
 SER  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.26500
   8  OG    OH    S    7   6   4     1.430   109.470   180.000  -0.70000
   9  HOG   HO    E    8   7   6     0.960   109.470   180.000   0.43500
  10  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  11  O     O2    E   10   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  12  OXT   O2    E   10   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

DONE
     THREONINE COO- ANION
THR
 THR  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    CZ    B    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.26500
   8  CG2   C3    E    7   6   4     1.525   109.470   300.000   0.00000
   9  OG1   OH    S    7   6   4     1.430   109.470    60.000  -0.70000
  10  HOG   HO    E    9   7   6     0.960   109.470   180.000   0.43500
  11  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  12  O     O2    E   11   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  13  OXT   O2    E   11   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CG2  CB   CA   OG1
 CA   OXT  C    O

DONE
     LEUCINE COO- ANION
LEU
 LEU  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    CZ    B    7   6   4     1.525   109.470   180.000   0.00000
   9  CD1   C3    E    8   7   6     1.525   109.470    60.000   0.00000
  10  CD2   C3    E    8   7   6     1.525   109.470   180.000   0.00000
  11  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  12  O     O2    E   11   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  13  OXT   O2    E   11   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CD1  CG   CB   CD2
 CA   OXT  C    O

DONE
      ISOLEUCINE COO- ANION
ILE
 ILE  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    CZ    B    6   4   3     1.525   109.470    60.000   0.00000
   8  CG2   C3    E    7   6   4     1.525   109.470    60.000   0.00000
   9  CG1   C2    S    7   6   4     1.525   109.470   180.000   0.00000
  10  CD1   CV    E    9   7   6     1.525   109.470   180.000   0.00000
  11  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  12  O     O2    E   11   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  13  OXT   O2    E   11   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CG2  CB   CA   CG1
 CA   OXT  C    O

DONE
     VALINE
VAL
 VAL  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    CZ    B    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG1   C3    E    7   6   4     1.525   109.470    60.000   0.00000
   9  CG2   C3    E    7   6   4     1.525   109.470   180.000   0.00000
  10  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  11  O     O2    E   10   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  12  OXT   O2    E   10   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CG1  CB   CA   CG2
 CA   OXT  C    O

DONE
      ASPARAGINE COO- ANION
ASN
 ASN  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    C     B    7   6   4     1.522   111.100   180.000   0.50000
   9  OD1   O     E    8   7   6     1.229   120.500     0.000  -0.50000
  10  ND2   N     B    8   7   6     1.335   116.600   180.000  -0.85000
  11  HND1  H     E   10   8   7     1.010   119.800     0.000   0.42500
  12  HND2  H     E   10   8   7     1.010   119.800   180.000   0.42500
  13  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  14  O     O2    E   13   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  15  OXT   O2    E   13   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CB   ND2  CG   OD1
 CG   HND1 ND2  HND2
 CA   OXT  C    O

DONE
    GLUTAMINE COO- ANION
 GLN
 GLN  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    C2    S    7   6   4     1.525   109.470   180.000   0.00000
   9  CD    C     B    8   7   6     1.522   111.100   180.000   0.50000
  10  OE1   O     E    9   8   7     1.229   120.500     0.000  -0.50000
  11  NE2   N     B    9   8   7     1.335   116.600   180.000  -0.85000
  12  HNE1  H     E   11   9   8     1.010   119.800     0.000   0.42500
  13  HNE2  H     E   11   9   8     1.010   119.800   180.000   0.42500
  14  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  15  O     O2    E   14   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  16  OXT   O2    E   14   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CG   NE2  CD   OE1
 CD   HNE1 NE2  HNE2
 CA   OXT  C    O

DONE
     PHENYLALANINE, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
 PHE
 PHE  INT    1
CORR  OMIT DU   BEG
  0.00
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.11500
   8  CG    CK    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000  -0.11500
   9  CD1   CK    B    8   7   6     1.400   120.000   180.000  -0.11500
  10  HD1   HK    E    9   8   7     1.090   120.000     0.000   0.11500
  11  CE1   CK    B    9   8   7     1.400   120.000   180.000  -0.11500
  12  HE1   HK    E   11   9   8     1.090   120.000   180.000   0.11500
  13  CZ    CK    B   11   9   8     1.400   120.000     0.000  -0.11500
  14  HZ    HK    E   13  11   9     1.090   120.000   180.000   0.11500
  15  CE2   CK    B   13  11   9     1.400   120.000     0.000  -0.11500
  16  HE2   HK    E   15  13  11     1.090   120.000   180.000   0.11500
  17  CD2   CK    S   15  13  11     1.400   120.000     0.000  -0.11500
  18  HD2   HK    E   17  15  13     1.090   120.000   180.000   0.11500
  14  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  15  O     O2    E   14   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  16  OXT   O2    E   14   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CG   CD2

DONE
     PHENYLALANINE, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
 PHU
 PHU  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    CA    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000   0.00000
   9  CD1   CD    S    8   7   6     1.400   120.000   180.000   0.00000
  10  CE1   CD    S    9   8   7     1.400   120.000   180.000   0.00000
  11  CZ    CD    S   10   9   8     1.400   120.000     0.000   0.00000
  12  CE2   CD    S   11  10   9     1.400   120.000     0.000   0.00000
  13  CD2   CD    E   12  11  10     1.400   120.000     0.000   0.00000
  14  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  15  O     O2    E   14   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  16  OXT   O2    E   14   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CG   CD2

DONE
      TYROSINE, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
 TYR
 TYR  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.11500
   8  CG    CK    S    7   6   4     1.510   109.470   180.000  -0.11500
   9  CD1   CK    B    8   7   6     1.400   120.000   180.000  -0.11500
  10  HD1   HK    E    9   8   7     1.090   120.000     0.000   0.11500
  11  CE1   CK    B    9   8   7     1.400   120.000   180.000  -0.11500
  12  HE1   HK    E   11   9   8     1.090   120.000   180.000   0.11500
  13  CZ    CK    B   11   9   8     1.400   120.000     0.000   0.15000
  14  OH    OH    S   13  11   9     1.360   120.000   180.000  -0.58500
  15  HOH   HO    E   14  13  11     0.960   113.000     0.000   0.43500
  16  CE2   CK    B   13  11   9     1.400   120.000     0.000  -0.11500
  17  HE2   HK    E   16  13  11     1.090   120.000   180.000   0.11500
  18  CD2   CK    S   16  13  11     1.400   120.000     0.000  -0.11500
  19  HD2   HK    E   18  16  13     1.090   120.000   180.000   0.11500
  20  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  21  O     O2    E   20   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  22  OXT   O2    E   20   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CG   CD2

DONE
      TYROSINE, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
 TYU
 TYU  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    CA    S    7   6   4     1.510   109.470   180.000   0.00000
   9  CD1   CD    S    8   7   6     1.400   120.000   180.000   0.00000
  10  CE1   CD    S    9   8   7     1.400   120.000   180.000   0.00000
  11  CZ    CA    B   10   9   8     1.400   120.000     0.000   0.26500
  12  OH    OH    S   11  10   9     1.360   120.000   180.000  -0.70000
  13  HOH   HO    E   12  11  10     0.960   113.000     0.000   0.43500
  14  CE2   CD    S   11  10   9     1.400   120.000     0.000   0.00000
  15  CD2   CD    E   14  11  10     1.400   120.000     0.000   0.00000
  16  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  17  O     O2    E   16   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  18  OXT   O2    E   16   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CG   CD2

DONE
      GLUTAMIC ACID COO- ANION
GLU
 GLU  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    C2    S    7   6   4     1.510   109.470   180.000  -0.10000
   9  CD    C     B    8   7   6     1.527   109.470   180.000   0.70000
  10  OE1   O2    E    9   8   7     1.260   117.200    90.000  -0.80000
  11  OE2   O2    E    9   8   7     1.260   117.200   270.000  -0.80000
  12  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  13  O     O2    E   12   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  14  OXT   O2    E   12   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CG   OE1  CD   OE2
 CA   OXT  C    O

DONE
     ASPARTIC ACID COO- ANION
ASP
 ASP  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000  -0.10000
   8  CG    C     B    7   6   4     1.527   109.470   180.000   0.70000
   9  OD1   O2    E    8   7   6     1.260   117.200    90.000  -0.80000
  10  OD2   O2    E    8   7   6     1.260   117.200   270.000  -0.80000
  11  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  12  O     O2    E   11   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  13  OXT   O2    E   11   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CB   OD1  CG   OD2
 CA   OXT  C    O

DONE
     LYSINE COO- ANION
LYS
 LYS  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    C2    S    7   6   4     1.525   109.470   180.000   0.00000
   9  CD    C2    S    8   7   6     1.525   109.470   180.000   0.00000
  10  CE    C2    S    9   8   7     1.525   109.470   180.000   0.31000
  11  NZ    N3    3   10   9   8     1.470   109.470   180.000  -0.30000
  12  HNZ1  H3    E   11  10   9     1.010   109.470    60.000   0.33000
  13  HNZ2  H3    E   11  10   9     1.010   109.470   180.000   0.33000
  14  HNZ3  H3    E   11  10   9     1.010   109.470   300.000   0.33000
  15  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  16  O     O2    E   15   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  17  OXT   O2    E   15   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

DONE
     PROLINE COO- ANION
PRO
 PRO  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.337   117.000   180.000  -0.57000
   5  CD    CQ    S    4   3   2     1.458   126.100   356.100   0.28500
   6  CG    C2    S    5   4   3     1.500   103.200   200.100   0.00000
   7  CB    C2    E    6   5   4     1.510   106.000   338.300   0.00000
   8  CA    CH    M    4   3   2     1.451   120.600   175.200   0.18500
   9  C     C     M    8   4   3     1.522   111.100     0.000   0.70000
  10  O     O2    E    9   8   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  11  OXT   O2    E    9   8   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 CB   CA   N    C
 -M   CA   N    CD
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CB   CA

DONE
     CYSTEINE COO- ANION
CYS
 CYS  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.18000
   8  SG    SH    S    7   6   4     1.810   116.000   180.000  -0.45000
   9  HG    HS    E    8   7   6     1.330    96.000   180.000   0.27000
  10  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  11  O     O2    E   10   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  12  OXT   O2    E   10   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

DONE
     CYSTINE(S-S BRIDGE) COO- ANION
CYX
 CYX  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    CQ    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.30000
   8  SG    S     E    7   6   4     1.810   116.000   180.000  -0.30000
   9  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  10  O     O2    E    9   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  11  OXT   O2    E    9   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

DONE
      METHIONINE COO- ANION
MET
 MET  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    CQ    S    7   6   4     1.525   109.470   180.000   0.23500
   9  SD    S     S    8   7   6     1.810   110.000   180.000  -0.47000
  10  CE    CW    E    9   8   7     1.780   100.000   180.000   0.23500
  11  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  12  O     O2    E   11   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  13  OXT   O2    E   11   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

DONE
     ARGININE COO- ANION
ARG
 ARG  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    C2    S    7   6   4     1.525   109.470   180.000   0.08000
   9  CD    C2    S    8   7   6     1.525   109.470   180.000   0.30000
  10  NE    N2    B    9   8   7     1.480   111.000   180.000  -0.70000
  11  HNE   H3    E   10   9   8     1.010   118.500     0.000   0.44000
  12  CZ    C     B   10   9   8     1.330   123.000   180.000   0.64000
  13  NH1   N2    B   12  10   9     1.330   122.000     0.000  -0.80000
  14  HN11  H3    E   13  12  10     1.010   119.800     0.000   0.46000
  15  HN12  H3    E   13  12  10     1.010   119.800   180.000   0.46000
  16  NH2   N2    B   12  10   9     1.330   118.000   180.000  -0.80000
  17  HN21  H3    E   16  12  10     1.010   119.800     0.000   0.46000
  18  HN22  H3    E   16  12  10     1.010   119.800   180.000   0.46000
  19  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  20  O     O2    E   19   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  21  OXT   O2    E   19   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 NE   NH1  CZ   NH2
 CA   OXT  C    O

DONE
      HISTIDINE DELTAH COO- ANION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
HID
 HID  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.11500
   8  CG    CK    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000   0.01500
   9  ND1   NA    B    8   7   6     1.390   122.000   180.000  -0.57000
  10  HND   H     E    9   8   7     1.010   126.000     0.000   0.42000
  11  CE1   CK    B    9   8   7     1.320   108.000   180.000   0.29500
  12  HE    HK    E   11   9   8     1.090   120.000   180.000   0.11500
  13  NE2   NB    S   11   9   8     1.310   109.000     0.000  -0.49000
  14  CD2   CK    S   13  11   9     1.360   110.000     0.000  -0.01500
  15  HD    HK    E   14  13  11     1.090   120.000   180.000   0.11500
  16  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  17  O     O2    E   16   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  18  OXT   O2    E   16   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O
 CG   CE1  ND1  HND

LOOP
 CG   CD2

DONE
      HISTIDINE EPSILONH COO- ANION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
HIE
 HIE  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.11500
   8  CG    CK    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000  -0.01500
   9  ND1   NB    S    8   7   6     1.390   122.000   180.000  -0.49000
  10  CE1   CK    B    9   8   7     1.320   108.000   180.000   0.29500
  11  HE    HK    E   10   9   8     1.090   120.000   180.000   0.11500
  12  NE2   NA    B   10   9   8     1.310   109.000     0.000  -0.57000
  13  HNE   H     E   12  10   9     1.010   125.000   180.000   0.42000
  14  CD2   CK    S   12  10   9     1.360   110.000     0.000   0.01500
  15  HD    HK    E   14  12  10     1.090   120.000   180.000   0.11500
  16  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  17  O     O2    E   16   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  18  OXT   O2    E   16   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O
 CE1  CD2  NE2  HNE

LOOP
 CG   CD2

DONE
      HISTIDINE PLUS ZWITTERION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
 HIP
 HIP  INT    1
 CORR OMIT DU   BEG
  0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.11500
   8  CG    CK    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000   0.21500
   9  ND1   NA    B    8   7   6     1.390   122.000   180.000  -0.54000
  10  HND   H     E    9   8   7     1.010   126.000     0.000   0.46000
  11  CE1   CK    B    9   8   7     1.320   108.000   180.000   0.38500
  12  HE    HK    E   11   9   8     1.090   120.000   180.000   0.11500
  13  NE2   NA    B   11   9   8     1.310   109.000     0.000  -0.54000
  14  HNE   H     E   13  11   9     1.010   125.000   180.000   0.46000
  15  CD2   CK    S   13  11   9     1.360   110.000     0.000   0.21500
  16  HD    HK    E   15  13  11     1.090   120.000   180.000   0.11500
  17  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  18  O     O     E   17   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  19  OXT   O     E   17   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O
 CG   CE1  ND1  HND
 CE1  CD2  NE2  HNE

LOOP
 CG   CD2

DONE
      TRYPTOPHAN COO- ANION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
TRP
 TRP  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.11500
   8  CG    CK    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000  -0.17000
   9  CD1   CK    B    8   7   6     1.340   127.000   180.000   0.01500
  10  HD    HK    E    9   8   7     1.090   120.000     0.000   0.11500
  11  NE1   NA    B    9   8   7     1.430   107.000   180.000  -0.57000
  12  HNE   H     E   11   9   8     1.010   125.500   180.000   0.42000
  13  CE2   CN    S   11   9   8     1.310   109.000     0.000   0.13000
  14  CZ2   CK    B   13  11   9     1.400   128.000   180.000  -0.11500
  15  HZ1   HK    E   14  13  11     1.090   120.000     0.000   0.11500
  16  CH2   CK    B   14  13  11     1.390   116.000   180.000  -0.11500
  17  HH    HK    E   16  14  13     1.090   120.000   180.000   0.11500
  18  CZ3   CK    B   16  14  13     1.350   121.000     0.000  -0.11500
  19  HZ2   HK    E   18  16  14     1.090   120.000   180.000   0.11500
  20  CE3   CK    B   18  16  14     1.410   122.000     0.000  -0.11500
  21  HE    HK    E   20  18  16     1.090   120.000   180.000   0.11500
  22  CD2   CB    E   20  18  16     1.400   117.000     0.000  -0.05500
  23  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  24  O     O2    E   23   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  25  OXT   O2    E   23   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O
 CD1  CE2  NE1  HNE
 CE2  CH2  CZ2  HZ1
 CZ2  CZ3  CH2  HH
 CH2  CE3  CZ3  HZ2
 CZ3  CD2  CE3  HE

LOOP
 CG   CD2
 CE2  CD2

DONE
      HISTIDINE DELTAH COO- ANION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
HDU
 HDU  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    CC    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000   0.13000
   9  ND1   NA    B    8   7   6     1.390   122.000   180.000  -0.57000
  10  HND   H     E    9   8   7     1.010   126.000     0.000   0.42000
  11  CE1   CP    S    9   8   7     1.320   108.000   180.000   0.41000
  12  NE2   NB    S   11   9   8     1.310   109.000     0.000  -0.49000
  13  CD2   CF    E   12  11   9     1.360   110.000     0.000   0.10000
  14  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  15  O     O2    E   14   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  16  OXT   O2    E   14   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CG   CD2

DONE
      HISTIDINE EPSILONH COO- ANION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
HEU
 HEU  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    CC    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000   0.10000
   9  ND1   NB    S    8   7   6     1.390   122.000   180.000  -0.49000
  10  CE1   CP    S    9   8   7     1.320   108.000   180.000   0.41000
  11  NE2   NA    B   10   9   8     1.310   109.000     0.000  -0.57000
  12  HNE   H     E   11  10   9     1.010   125.000   180.000   0.42000
  13  CD2   CG    E   11  10   9     1.360   110.000     0.000   0.13000
  14  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  15  O     O2    E   14   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  16  OXT   O2    E   14   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CG   CD2

DONE
      HISTIDINE PLUS ZWITTERION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
 HPU
 HPU  INT    1
 CORR OMIT DU   BEG
  0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    CC    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000   0.33000
   9  ND1   NA    B    8   7   6     1.390   122.000   180.000  -0.54000
  10  HND   H     E    9   8   7     1.010   126.000     0.000   0.46000
  11  CE1   CP    S    9   8   7     1.320   108.000   180.000   0.50000
  12  NE2   NA    B   11   9   8     1.310   109.000     0.000  -0.54000
  13  HNE   H     E   12  11   9     1.010   125.000   180.000   0.46000
  14  CD2   CG    E   12  11   9     1.360   110.000     0.000   0.33000
  15  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  16  O     O     E   15   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  17  OXT   O     E   15   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O

LOOP
 CG   CD2

DONE
      TRYPTOPHAN COO- ANION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
TRU
 TRU  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  N     N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CA    CH    M    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.10000
   7  CB    C2    S    6   4   3     1.525   111.100    60.000   0.00000
   8  CG    C*    S    7   6   4     1.510   115.000   180.000  -0.05500
   9  CD1   CG    S    8   7   6     1.340   127.000   180.000   0.13000
  10  NE1   NA    B    9   8   7     1.430   107.000   180.000  -0.57000
  11  HNE   H     E   10   9   8     1.010   125.500   180.000   0.42000
  12  CE2   CN    S   10   9   8     1.310   109.000     0.000   0.13000
  13  CZ2   CD    S   12  10   9     1.400   128.000   180.000   0.00000
  14  CH2   CD    S   13  12  10     1.390   116.000   180.000   0.00000
  15  CZ3   CD    S   14  13  12     1.350   121.000     0.000   0.00000
  16  CE3   CD    S   15  14  13     1.410   122.000     0.000   0.00000
  17  CD2   CB    E   16  15  14     1.400   117.000     0.000  -0.05500
  18  C     C     M    6   4   3     1.522   111.100   180.000   0.70000
  19  O     O2    E   18   6   4     1.229   120.500     0.000  -0.80000
  20  OXT   O2    E   18   6   4     1.229   120.500   180.000  -0.80000

IMPROPER
 -M   CA   N    HN
 CB   CA   N    C
 CA   OXT  C    O


LOOP
 CG   CD2
 CE2  CD2

DONE
    TERMINAL METHYL AMIDE, OPLS MODEL
AME
 AME  INT     1
 CORR OMIT DU   BEG
   0.00000
   1  DUMM  DU    M    0  -1  -2     0.000     0.000     0.000   0.00000
   2  DUMM  DU    M    1   0  -1     1.449     0.000     0.000   0.00000
   3  DUMM  DU    M    2   1   0     1.522   111.100     0.000   0.00000
   4  NT    N     M    3   2   1     1.335   116.600   180.000  -0.57000
   5  HN    H     E    4   3   2     1.010   119.800     0.000   0.37000
   6  CT    CW    E    4   3   2     1.449   121.900   180.000   0.20000

DONE
STOP
