@RG ID:100307F3V44W SM:unknown PI:0 PL:454 Mapping quality threshold:20 LF fragment mapping length (-mfl: 0; -ls: 0) TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 -nan -nan 0 0 0 bin x n cum LR read mapping length TOT MEAN STD IN OVER UNDER 146713 171.155 61.313 146713 0 0 bin x n cum 14 14 1 1 17 17 3 4 18 18 2 6 19 19 2 8 20 20 2 10 21 21 6 16 22 22 14 30 23 23 65 95 24 24 8 103 25 25 16 119 26 26 22 141 27 27 8 149 28 28 11 160 29 29 15 175 30 30 11 186 31 31 23 209 32 32 41 250 33 33 36 286 34 34 81 367 35 35 72 439 36 36 82 521 37 37 89 610 38 38 76 686 39 39 88 774 40 40 69 843 41 41 95 938 42 42 117 1055 43 43 109 1164 44 44 107 1271 45 45 98 1369 46 46 112 1481 47 47 126 1607 48 48 137 1744 49 49 149 1893 50 50 123 2016 51 51 152 2168 52 52 169 2337 53 53 225 2562 54 54 166 2728 55 55 178 2906 56 56 176 3082 57 57 183 3265 58 58 224 3489 59 59 192 3681 60 60 232 3913 61 61 208 4121 62 62 201 4322 63 63 204 4526 64 64 270 4796 65 65 272 5068 66 66 236 5304 67 67 217 5521 68 68 253 5774 69 69 316 6090 70 70 241 6331 71 71 273 6604 72 72 286 6890 73 73 279 7169 74 74 283 7452 75 75 266 7718 76 76 333 8051 77 77 288 8339 78 78 271 8610 79 79 275 8885 80 80 254 9139 81 81 279 9418 82 82 372 9790 83 83 317 10107 84 84 320 10427 85 85 320 10747 86 86 392 11139 87 87 386 11525 88 88 421 11946 89 89 376 12322 90 90 728 13050 91 91 608 13658 92 92 473 14131 93 93 796 14927 94 94 600 15527 95 95 556 16083 96 96 424 16507 97 97 513 17020 98 98 707 17727 99 99 438 18165 100 100 545 18710 101 101 820 19530 102 102 507 20037 103 103 582 20619 104 104 740 21359 105 105 1570 22929 106 106 1302 24231 107 107 866 25097 108 108 3733 28830 109 109 890 29720 110 110 1114 30834 111 111 765 31599 112 112 683 32282 113 113 1553 33835 114 114 981 34816 115 115 1919 36735 116 116 933 37668 117 117 639 38307 118 118 546 38853 119 119 513 39366 120 120 586 39952 121 121 561 40513 122 122 2612 43125 123 123 963 44088 124 124 545 44633 125 125 501 45134 126 126 652 45786 127 127 557 46343 128 128 445 46788 129 129 481 47269 130 130 497 47766 131 131 402 48168 132 132 597 48765 133 133 385 49150 134 134 597 49747 135 135 400 50147 136 136 659 50806 137 137 453 51259 138 138 571 51830 139 139 1728 53558 140 140 541 54099 141 141 863 54962 142 142 642 55604 143 143 633 56237 144 144 810 57047 145 145 512 57559 146 146 420 57979 147 147 545 58524 148 148 480 59004 149 149 459 59463 150 150 411 59874 151 151 382 60256 152 152 373 60629 153 153 451 61080 154 154 369 61449 155 155 492 61941 156 156 626 62567 157 157 509 63076 158 158 450 63526 159 159 472 63998 160 160 387 64385 161 161 402 64787 162 162 321 65108 163 163 344 65452 164 164 434 65886 165 165 528 66414 166 166 444 66858 167 167 463 67321 168 168 374 67695 169 169 363 68058 170 170 350 68408 171 171 391 68799 172 172 392 69191 173 173 404 69595 174 174 321 69916 175 175 275 70191 176 176 321 70512 177 177 362 70874 178 178 356 71230 179 179 360 71590 180 180 548 72138 181 181 902 73040 182 182 1453 74493 183 183 582 75075 184 184 472 75547 185 185 454 76001 186 186 532 76533 187 187 538 77071 188 188 668 77739 189 189 960 78699 190 190 980 79679 191 191 867 80546 192 192 914 81460 193 193 1258 82718 194 194 761 83479 195 195 1006 84485 196 196 971 85456 197 197 666 86122 198 198 785 86907 199 199 511 87418 200 200 694 88112 201 201 848 88960 202 202 1199 90159 203 203 1399 91558 204 204 2002 93560 205 205 1736 95296 206 206 1763 97059 207 207 2567 99626 208 208 2438 102064 209 209 1720 103784 210 210 1513 105297 211 211 1297 106594 212 212 1030 107624 213 213 797 108421 214 214 583 109004 215 215 647 109651 216 216 506 110157 217 217 456 110613 218 218 494 111107 219 219 657 111764 220 220 1237 113001 221 221 2191 115192 222 222 694 115886 223 223 839 116725 224 224 688 117413 225 225 1063 118476 226 226 1412 119888 227 227 601 120489 228 228 739 121228 229 229 443 121671 230 230 391 122062 231 231 341 122403 232 232 357 122760 233 233 388 123148 234 234 435 123583 235 235 411 123994 236 236 611 124605 237 237 977 125582 238 238 1609 127191 239 239 2039 129230 240 240 1040 130270 241 241 491 130761 242 242 390 131151 243 243 416 131567 244 244 499 132066 245 245 358 132424 246 246 409 132833 247 247 472 133305 248 248 519 133824 249 249 407 134231 250 250 332 134563 251 251 313 134876 252 252 260 135136 253 253 268 135404 254 254 186 135590 255 255 188 135778 256 256 244 136022 257 257 286 136308 258 258 265 136573 259 259 319 136892 260 260 265 137157 261 261 323 137480 262 262 363 137843 263 263 348 138191 264 264 222 138413 265 265 210 138623 266 266 181 138804 267 267 178 138982 268 268 226 139208 269 269 232 139440 270 270 202 139642 271 271 222 139864 272 272 214 140078 273 273 220 140298 274 274 203 140501 275 275 196 140697 276 276 162 140859 277 277 139 140998 278 278 136 141134 279 279 137 141271 280 280 145 141416 281 281 143 141559 282 282 138 141697 283 283 138 141835 284 284 187 142022 285 285 190 142212 286 286 213 142425 287 287 243 142668 288 288 208 142876 289 289 206 143082 290 290 204 143286 291 291 214 143500 292 292 212 143712 293 293 237 143949 294 294 264 144213 295 295 291 144504 296 296 255 144759 297 297 245 145004 298 298 201 145205 299 299 160 145365 300 300 176 145541 301 301 163 145704 302 302 121 145825 303 303 118 145943 304 304 122 146065 305 305 96 146161 306 306 90 146251 307 307 66 146317 308 308 87 146404 309 309 51 146455 310 310 46 146501 311 311 39 146540 312 312 24 146564 313 313 22 146586 314 314 23 146609 315 315 13 146622 316 316 13 146635 317 317 14 146649 318 318 14 146663 319 319 10 146673 320 320 6 146679 321 321 7 146686 322 322 5 146691 323 323 1 146692 324 324 7 146699 325 325 1 146700 326 326 3 146703 327 327 1 146704 328 328 2 146706 329 329 3 146709 330 330 1 146710 333 333 1 146711 337 337 1 146712 345 345 1 146713 NA read mapping multiplicity TOT MEAN STD IN OVER UNDER 146713 9.350 4.442 146713 0 0 bin x n cum 1 1 11228 11228 2 2 16893 28121 3 3 2484 30605 4 4 1559 32164 5 5 1768 33932 6 6 2139 36071 7 7 4277 40348 8 8 11368 51716 9 9 2900 54616 10 10 4503 59119 11 11 13237 72356 12 12 13282 85638 13 13 61024 146662 14 14 6 146668 15 15 4 146672 16 16 1 146673 17 17 3 146676 18 18 3 146679 19 19 2 146681 21 21 1 146682 22 22 4 146686 23 23 7 146693 24 24 1 146694 25 25 8 146702 26 26 11 146713 RQ read map quality TOT MEAN STD IN OVER UNDER 146713 0.000 0.000 146713 0 0 bin x n cum 0 0 146713 146713 MM read map mismatch (-mm/-mmp: 0.50) TOT MEAN STD IN OVER UNDER 145833 33.895 23.432 143347 2486 0 bin x n cum 0 0 2518 2518 1 1 2790 5308 2 2 2439 7747 3 3 1939 9686 4 4 2739 12425 5 5 3497 15922 6 6 2704 18626 7 7 2835 21461 8 8 2684 24145 9 9 2212 26357 10 10 2567 28924 11 11 2496 31420 12 12 2018 33438 13 13 2195 35633 14 14 1947 37580 15 15 2081 39661 16 16 2087 41748 17 17 1865 43613 18 18 1445 45058 19 19 1668 46726 20 20 1475 48201 21 21 1512 49713 22 22 1314 51027 23 23 1152 52179 24 24 1530 53709 25 25 1286 54995 26 26 1886 56881 27 27 2515 59396 28 28 2217 61613 29 29 3078 64691 30 30 2771 67462 31 31 3067 70529 32 32 2492 73021 33 33 2980 76001 34 34 3130 79131 35 35 2407 81538 36 36 1695 83233 37 37 4425 87658 38 38 1776 89434 39 39 1314 90748 40 40 1582 92330 41 41 1559 93889 42 42 1511 95400 43 43 1484 96884 44 44 1949 98833 45 45 1407 100240 46 46 1846 102086 47 47 2101 104187 48 48 1334 105521 49 49 1615 107136 50 50 883 108019 51 51 975 108994 52 52 1066 110060 53 53 867 110927 54 54 2823 113750 55 55 2157 115907 56 56 1970 117877 57 57 2345 120222 58 58 1315 121537 59 59 2339 123876 60 60 2308 126184 61 61 2025 128209 62 62 1545 129754 63 63 957 130711 64 64 743 131454 65 65 638 132092 66 66 498 132590 67 67 460 133050 68 68 404 133454 69 69 343 133797 70 70 360 134157 71 71 323 134480 72 72 260 134740 73 73 251 134991 74 74 223 135214 75 75 222 135436 76 76 206 135642 77 77 365 136007 78 78 352 136359 79 79 242 136601 80 80 276 136877 81 81 213 137090 82 82 188 137278 83 83 287 137565 84 84 272 137837 85 85 338 138175 86 86 254 138429 87 87 189 138618 88 88 213 138831 89 89 215 139046 90 90 218 139264 91 91 172 139436 92 92 136 139572 93 93 137 139709 94 94 179 139888 95 95 209 140097 96 96 494 140591 97 97 538 141129 98 98 330 141459 99 99 1888 143347 MC mate multiplicity combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 10263218 0 0 10263218 0 0 bin combo n cum label 1 1 11228 11228 Uniquely-aligned (U) 2 2 135485 146713 Multiply-aligned (M) 3 3 32940 179653 Filtered-out (F) 4 4 10083565 10263218 Unmapped (X) RC pair multiplicity combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 U-U 2 2 0 0 U-M 3 3 0 0 M-M 4 4 0 0 U-F 5 5 0 0 M-F 6 6 0 0 U-X 7 7 0 0 M-X 8 8 0 0 F-F 9 9 0 0 F-X 10 10 0 0 X-X LS local search TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 UU-LocalRescue 2 2 0 0 UM-LocalRescue 3 3 0 0 MM-LocalRescue 4 4 0 0 UU-localConsistance 5 5 0 0 UM-localConsistance 6 6 0 0 MM-localConsistance OC orientation combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 f1-f2 2 2 0 0 f1-r2 3 3 0 0 r1-f2 4 4 0 0 r1-r2 5 5 0 0 f2-f1 6 6 0 0 f2-r1 7 7 0 0 r2-f1 8 8 0 0 r2-r1