@RG ID:10055I90VVWI SM:unknown PI:0 PL:454 Mapping quality threshold:20 LF fragment mapping length (-mfl: 0; -ls: 0) TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 -nan -nan 0 0 0 bin x n cum LR read mapping length TOT MEAN STD IN OVER UNDER 152449 152.653 62.353 152449 0 0 bin x n cum 15 15 70 70 16 16 86 156 17 17 78 234 18 18 74 308 19 19 68 376 20 20 90 466 21 21 95 561 22 22 106 667 23 23 128 795 24 24 140 935 25 25 139 1074 26 26 148 1222 27 27 148 1370 28 28 126 1496 29 29 148 1644 30 30 160 1804 31 31 178 1982 32 32 177 2159 33 33 184 2343 34 34 193 2536 35 35 204 2740 36 36 192 2932 37 37 183 3115 38 38 202 3317 39 39 215 3532 40 40 215 3747 41 41 248 3995 42 42 264 4259 43 43 227 4486 44 44 285 4771 45 45 223 4994 46 46 328 5322 47 47 272 5594 48 48 288 5882 49 49 356 6238 50 50 291 6529 51 51 273 6802 52 52 307 7109 53 53 344 7453 54 54 294 7747 55 55 280 8027 56 56 375 8402 57 57 327 8729 58 58 324 9053 59 59 351 9404 60 60 333 9737 61 61 412 10149 62 62 357 10506 63 63 512 11018 64 64 378 11396 65 65 317 11713 66 66 344 12057 67 67 320 12377 68 68 359 12736 69 69 327 13063 70 70 416 13479 71 71 425 13904 72 72 474 14378 73 73 392 14770 74 74 501 15271 75 75 1025 16296 76 76 553 16849 77 77 865 17714 78 78 926 18640 79 79 411 19051 80 80 563 19614 81 81 827 20441 82 82 502 20943 83 83 544 21487 84 84 652 22139 85 85 1507 23646 86 86 1065 24711 87 87 688 25399 88 88 3870 29269 89 89 898 30167 90 90 1055 31222 91 91 718 31940 92 92 1077 33017 93 93 826 33843 94 94 857 34700 95 95 1549 36249 96 96 760 37009 97 97 1841 38850 98 98 620 39470 99 99 593 40063 100 100 528 40591 101 101 552 41143 102 102 563 41706 103 103 702 42408 104 104 2643 45051 105 105 1058 46109 106 106 726 46835 107 107 615 47450 108 108 853 48303 109 109 538 48841 110 110 639 49480 111 111 610 50090 112 112 592 50682 113 113 715 51397 114 114 595 51992 115 115 777 52769 116 116 807 53576 117 117 676 54252 118 118 574 54826 119 119 604 55430 120 120 1616 57046 121 121 915 57961 122 122 1083 59044 123 123 704 59748 124 124 871 60619 125 125 538 61157 126 126 513 61670 127 127 567 62237 128 128 473 62710 129 129 468 63178 130 130 454 63632 131 131 433 64065 132 132 443 64508 133 133 385 64893 134 134 463 65356 135 135 419 65775 136 136 595 66370 137 137 452 66822 138 138 572 67394 139 139 414 67808 140 140 498 68306 141 141 365 68671 142 142 377 69048 143 143 352 69400 144 144 387 69787 145 145 422 70209 146 146 503 70712 147 147 620 71332 148 148 445 71777 149 149 393 72170 150 150 338 72508 151 151 346 72854 152 152 403 73257 153 153 398 73655 154 154 345 74000 155 155 368 74368 156 156 315 74683 157 157 396 75079 158 158 324 75403 159 159 394 75797 160 160 404 76201 161 161 376 76577 162 162 514 77091 163 163 879 77970 164 164 1397 79367 165 165 544 79911 166 166 527 80438 167 167 473 80911 168 168 408 81319 169 169 525 81844 170 170 642 82486 171 171 771 83257 172 172 578 83835 173 173 563 84398 174 174 551 84949 175 175 533 85482 176 176 479 85961 177 177 764 86725 178 178 921 87646 179 179 672 88318 180 180 793 89111 181 181 525 89636 182 182 427 90063 183 183 648 90711 184 184 975 91686 185 185 694 92380 186 186 670 93050 187 187 1077 94127 188 188 904 95031 189 189 1407 96438 190 190 1799 98237 191 191 1345 99582 192 192 1599 101181 193 193 1741 102922 194 194 2019 104941 195 195 1294 106235 196 196 989 107224 197 197 1087 108311 198 198 709 109020 199 199 614 109634 200 200 695 110329 201 201 1082 111411 202 202 2101 113512 203 203 4057 117569 204 204 1198 118767 205 205 1431 120198 206 206 1047 121245 207 207 1244 122489 208 208 1320 123809 209 209 1233 125042 210 210 815 125857 211 211 549 126406 212 212 461 126867 213 213 415 127282 214 214 389 127671 215 215 417 128088 216 216 436 128524 217 217 408 128932 218 218 585 129517 219 219 893 130410 220 220 1477 131887 221 221 2058 133945 222 222 1318 135263 223 223 581 135844 224 224 401 136245 225 225 472 136717 226 226 480 137197 227 227 383 137580 228 228 486 138066 229 229 660 138726 230 230 511 139237 231 231 343 139580 232 232 349 139929 233 233 313 140242 234 234 264 140506 235 235 263 140769 236 236 205 140974 237 237 193 141167 238 238 217 141384 239 239 235 141619 240 240 267 141886 241 241 334 142220 242 242 289 142509 243 243 315 142824 244 244 383 143207 245 245 347 143554 246 246 255 143809 247 247 233 144042 248 248 187 144229 249 249 235 144464 250 250 289 144753 251 251 324 145077 252 252 226 145303 253 253 244 145547 254 254 248 145795 255 255 227 146022 256 256 203 146225 257 257 190 146415 258 258 178 146593 259 259 162 146755 260 260 133 146888 261 261 153 147041 262 262 155 147196 263 263 139 147335 264 264 158 147493 265 265 158 147651 266 266 204 147855 267 267 201 148056 268 268 186 148242 269 269 217 148459 270 270 228 148687 271 271 232 148919 272 272 219 149138 273 273 202 149340 274 274 244 149584 275 275 230 149814 276 276 291 150105 277 277 287 150392 278 278 227 150619 279 279 198 150817 280 280 221 151038 281 281 172 151210 282 282 141 151351 283 283 157 151508 284 284 114 151622 285 285 119 151741 286 286 129 151870 287 287 103 151973 288 288 86 152059 289 289 65 152124 290 290 52 152176 291 291 53 152229 292 292 47 152276 293 293 32 152308 294 294 23 152331 295 295 22 152353 296 296 14 152367 297 297 13 152380 298 298 11 152391 299 299 11 152402 300 300 8 152410 301 301 8 152418 302 302 5 152423 303 303 5 152428 304 304 6 152434 305 305 2 152436 307 307 2 152438 308 308 3 152441 309 309 2 152443 311 311 2 152445 313 313 1 152446 316 316 1 152447 318 318 1 152448 356 356 1 152449 NA read mapping multiplicity TOT MEAN STD IN OVER UNDER 152449 10.391 4.257 152449 0 0 bin x n cum 1 1 5403 5403 2 2 19462 24865 3 3 1354 26219 4 4 1480 27699 5 5 1051 28750 6 6 862 29612 7 7 2003 31615 8 8 5417 37032 9 9 1375 38407 10 10 2380 40787 11 11 9090 49877 12 12 8300 58177 13 13 94174 152351 14 14 16 152367 15 15 10 152377 16 16 9 152386 17 17 6 152392 18 18 8 152400 19 19 5 152405 20 20 2 152407 21 21 2 152409 22 22 5 152414 23 23 4 152418 24 24 10 152428 25 25 8 152436 26 26 7 152443 27 27 1 152444 28 28 3 152447 35 35 1 152448 37 37 1 152449 RQ read map quality TOT MEAN STD IN OVER UNDER 152449 0.000 0.000 152449 0 0 bin x n cum 0 0 152449 152449 MM read map mismatch (-mm/-mmp: 0.50) TOT MEAN STD IN OVER UNDER 152406 13.731 16.943 151511 895 0 bin x n cum 0 0 23403 23403 1 1 17438 40841 2 2 14262 55103 3 3 9968 65071 4 4 6762 71833 5 5 4773 76606 6 6 3459 80065 7 7 2387 82452 8 8 1569 84021 9 9 1283 85304 10 10 1308 86612 11 11 1237 87849 12 12 962 88811 13 13 862 89673 14 14 3206 92879 15 15 3193 96072 16 16 3027 99099 17 17 3873 102972 18 18 1728 104700 19 19 1466 106166 20 20 696 106862 21 21 669 107531 22 22 464 107995 23 23 557 108552 24 24 11834 120386 25 25 1511 121897 26 26 1041 122938 27 27 715 123653 28 28 1572 125225 29 29 4473 129698 30 30 3334 133032 31 31 1737 134769 32 32 1801 136570 33 33 1238 137808 34 34 962 138770 35 35 770 139540 36 36 568 140108 37 37 539 140647 38 38 523 141170 39 39 558 141728 40 40 531 142259 41 41 626 142885 42 42 414 143299 43 43 401 143700 44 44 302 144002 45 45 269 144271 46 46 224 144495 47 47 188 144683 48 48 228 144911 49 49 206 145117 50 50 209 145326 51 51 181 145507 52 52 312 145819 53 53 223 146042 54 54 205 146247 55 55 178 146425 56 56 176 146601 57 57 146 146747 58 58 164 146911 59 59 150 147061 60 60 141 147202 61 61 129 147331 62 62 117 147448 63 63 140 147588 64 64 168 147756 65 65 169 147925 66 66 172 148097 67 67 164 148261 68 68 326 148587 69 69 244 148831 70 70 180 149011 71 71 108 149119 72 72 118 149237 73 73 95 149332 74 74 118 149450 75 75 102 149552 76 76 98 149650 77 77 123 149773 78 78 85 149858 79 79 75 149933 80 80 68 150001 81 81 84 150085 82 82 98 150183 83 83 104 150287 84 84 72 150359 85 85 76 150435 86 86 65 150500 87 87 52 150552 88 88 64 150616 89 89 67 150683 90 90 84 150767 91 91 165 150932 92 92 145 151077 93 93 88 151165 94 94 79 151244 95 95 71 151315 96 96 55 151370 97 97 60 151430 98 98 34 151464 99 99 47 151511 MC mate multiplicity combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 3924303 0 0 3924303 0 0 bin combo n cum label 1 1 5403 5403 Uniquely-aligned (U) 2 2 147046 152449 Multiply-aligned (M) 3 3 20980 173429 Filtered-out (F) 4 4 3750874 3924303 Unmapped (X) RC pair multiplicity combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 U-U 2 2 0 0 U-M 3 3 0 0 M-M 4 4 0 0 U-F 5 5 0 0 M-F 6 6 0 0 U-X 7 7 0 0 M-X 8 8 0 0 F-F 9 9 0 0 F-X 10 10 0 0 X-X LS local search TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 UU-LocalRescue 2 2 0 0 UM-LocalRescue 3 3 0 0 MM-LocalRescue 4 4 0 0 UU-localConsistance 5 5 0 0 UM-localConsistance 6 6 0 0 MM-localConsistance OC orientation combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 f1-f2 2 2 0 0 f1-r2 3 3 0 0 r1-f2 4 4 0 0 r1-r2 5 5 0 0 f2-f1 6 6 0 0 f2-r1 7 7 0 0 r2-f1 8 8 0 0 r2-r1