@RG ID:100307F3V44W SM:unknown PI:0 PL:454 Mapping quality threshold:20 LF fragment mapping length (-mfl: 0; -ls: 0) TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 -nan -nan 0 0 0 bin x n cum LR read mapping length TOT MEAN STD IN OVER UNDER 146633 171.205 61.287 146633 0 0 bin x n cum 14 14 1 1 17 17 3 4 18 18 2 6 19 19 2 8 20 20 2 10 21 21 6 16 22 22 14 30 23 23 65 95 24 24 8 103 25 25 16 119 26 26 22 141 27 27 8 149 28 28 11 160 29 29 15 175 30 30 11 186 31 31 22 208 32 32 41 249 33 33 36 285 34 34 81 366 35 35 72 438 36 36 82 520 37 37 83 603 38 38 75 678 39 39 88 766 40 40 69 835 41 41 95 930 42 42 116 1046 43 43 107 1153 44 44 107 1260 45 45 98 1358 46 46 112 1470 47 47 125 1595 48 48 135 1730 49 49 147 1877 50 50 122 1999 51 51 150 2149 52 52 166 2315 53 53 225 2540 54 54 166 2706 55 55 176 2882 56 56 176 3058 57 57 181 3239 58 58 223 3462 59 59 190 3652 60 60 232 3884 61 61 207 4091 62 62 199 4290 63 63 203 4493 64 64 270 4763 65 65 270 5033 66 66 235 5268 67 67 217 5485 68 68 252 5737 69 69 315 6052 70 70 241 6293 71 71 273 6566 72 72 286 6852 73 73 279 7131 74 74 282 7413 75 75 265 7678 76 76 333 8011 77 77 285 8296 78 78 270 8566 79 79 274 8840 80 80 254 9094 81 81 278 9372 82 82 372 9744 83 83 316 10060 84 84 318 10378 85 85 319 10697 86 86 392 11089 87 87 386 11475 88 88 421 11896 89 89 376 12272 90 90 728 13000 91 91 607 13607 92 92 474 14081 93 93 795 14876 94 94 598 15474 95 95 555 16029 96 96 424 16453 97 97 512 16965 98 98 707 17672 99 99 437 18109 100 100 545 18654 101 101 820 19474 102 102 506 19980 103 103 581 20561 104 104 740 21301 105 105 1569 22870 106 106 1301 24171 107 107 865 25036 108 108 3733 28769 109 109 884 29653 110 110 1112 30765 111 111 763 31528 112 112 682 32210 113 113 1553 33763 114 114 981 34744 115 115 1919 36663 116 116 933 37596 117 117 638 38234 118 118 546 38780 119 119 513 39293 120 120 586 39879 121 121 561 40440 122 122 2612 43052 123 123 963 44015 124 124 543 44558 125 125 500 45058 126 126 652 45710 127 127 555 46265 128 128 445 46710 129 129 480 47190 130 130 496 47686 131 131 402 48088 132 132 597 48685 133 133 385 49070 134 134 596 49666 135 135 402 50068 136 136 659 50727 137 137 453 51180 138 138 571 51751 139 139 1728 53479 140 140 541 54020 141 141 863 54883 142 142 642 55525 143 143 633 56158 144 144 810 56968 145 145 512 57480 146 146 420 57900 147 147 545 58445 148 148 480 58925 149 149 459 59384 150 150 411 59795 151 151 382 60177 152 152 373 60550 153 153 451 61001 154 154 369 61370 155 155 492 61862 156 156 626 62488 157 157 509 62997 158 158 450 63447 159 159 472 63919 160 160 387 64306 161 161 402 64708 162 162 321 65029 163 163 344 65373 164 164 434 65807 165 165 528 66335 166 166 444 66779 167 167 463 67242 168 168 374 67616 169 169 363 67979 170 170 350 68329 171 171 391 68720 172 172 392 69112 173 173 404 69516 174 174 321 69837 175 175 275 70112 176 176 321 70433 177 177 362 70795 178 178 356 71151 179 179 360 71511 180 180 548 72059 181 181 902 72961 182 182 1453 74414 183 183 582 74996 184 184 472 75468 185 185 454 75922 186 186 532 76454 187 187 538 76992 188 188 668 77660 189 189 960 78620 190 190 980 79600 191 191 867 80467 192 192 914 81381 193 193 1258 82639 194 194 761 83400 195 195 1006 84406 196 196 971 85377 197 197 666 86043 198 198 785 86828 199 199 511 87339 200 200 694 88033 201 201 848 88881 202 202 1199 90080 203 203 1399 91479 204 204 2002 93481 205 205 1736 95217 206 206 1763 96980 207 207 2567 99547 208 208 2438 101985 209 209 1720 103705 210 210 1513 105218 211 211 1297 106515 212 212 1030 107545 213 213 797 108342 214 214 583 108925 215 215 647 109572 216 216 506 110078 217 217 456 110534 218 218 494 111028 219 219 657 111685 220 220 1237 112922 221 221 2191 115113 222 222 694 115807 223 223 839 116646 224 224 688 117334 225 225 1063 118397 226 226 1412 119809 227 227 601 120410 228 228 739 121149 229 229 443 121592 230 230 391 121983 231 231 341 122324 232 232 357 122681 233 233 388 123069 234 234 434 123503 235 235 411 123914 236 236 611 124525 237 237 977 125502 238 238 1609 127111 239 239 2039 129150 240 240 1040 130190 241 241 491 130681 242 242 390 131071 243 243 416 131487 244 244 499 131986 245 245 358 132344 246 246 409 132753 247 247 472 133225 248 248 519 133744 249 249 407 134151 250 250 332 134483 251 251 313 134796 252 252 260 135056 253 253 268 135324 254 254 186 135510 255 255 188 135698 256 256 244 135942 257 257 286 136228 258 258 265 136493 259 259 319 136812 260 260 265 137077 261 261 323 137400 262 262 363 137763 263 263 348 138111 264 264 222 138333 265 265 210 138543 266 266 181 138724 267 267 178 138902 268 268 226 139128 269 269 232 139360 270 270 202 139562 271 271 222 139784 272 272 214 139998 273 273 220 140218 274 274 203 140421 275 275 196 140617 276 276 162 140779 277 277 139 140918 278 278 136 141054 279 279 137 141191 280 280 145 141336 281 281 143 141479 282 282 138 141617 283 283 138 141755 284 284 187 141942 285 285 190 142132 286 286 213 142345 287 287 243 142588 288 288 208 142796 289 289 206 143002 290 290 204 143206 291 291 214 143420 292 292 212 143632 293 293 237 143869 294 294 264 144133 295 295 291 144424 296 296 255 144679 297 297 245 144924 298 298 201 145125 299 299 160 145285 300 300 176 145461 301 301 163 145624 302 302 121 145745 303 303 118 145863 304 304 122 145985 305 305 96 146081 306 306 90 146171 307 307 66 146237 308 308 87 146324 309 309 51 146375 310 310 46 146421 311 311 39 146460 312 312 24 146484 313 313 22 146506 314 314 23 146529 315 315 13 146542 316 316 13 146555 317 317 14 146569 318 318 14 146583 319 319 10 146593 320 320 6 146599 321 321 7 146606 322 322 5 146611 323 323 1 146612 324 324 7 146619 325 325 1 146620 326 326 3 146623 327 327 1 146624 328 328 2 146626 329 329 3 146629 330 330 1 146630 333 333 1 146631 337 337 1 146632 345 345 1 146633 NA read mapping multiplicity TOT MEAN STD IN OVER UNDER 146633 9.350 4.442 146633 0 0 bin x n cum 1 1 11215 11215 2 2 16887 28102 3 3 2473 30575 4 4 1566 32141 5 5 1768 33909 6 6 2139 36048 7 7 4295 40343 8 8 11358 51701 9 9 2896 54597 10 10 4488 59085 11 11 13253 72338 12 12 13274 85612 13 13 60970 146582 14 14 6 146588 15 15 4 146592 16 16 1 146593 17 17 3 146596 18 18 3 146599 19 19 2 146601 21 21 1 146602 22 22 4 146606 23 23 7 146613 24 24 1 146614 25 25 8 146622 26 26 11 146633 RQ read map quality TOT MEAN STD IN OVER UNDER 146633 0.000 0.000 146633 0 0 bin x n cum 0 0 146633 146633 MM read map mismatch (-mm/-mmp: 0.50) TOT MEAN STD IN OVER UNDER 145753 33.899 23.435 143268 2485 0 bin x n cum 0 0 2518 2518 1 1 2790 5308 2 2 2439 7747 3 3 1940 9687 4 4 2739 12426 5 5 3494 15920 6 6 2704 18624 7 7 2834 21458 8 8 2677 24135 9 9 2210 26345 10 10 2566 28911 11 11 2494 31405 12 12 2014 33419 13 13 2193 35612 14 14 1945 37557 15 15 2078 39635 16 16 2085 41720 17 17 1865 43585 18 18 1442 45027 19 19 1666 46693 20 20 1474 48167 21 21 1511 49678 22 22 1312 50990 23 23 1151 52141 24 24 1529 53670 25 25 1285 54955 26 26 1884 56839 27 27 2514 59353 28 28 2216 61569 29 29 3077 64646 30 30 2768 67414 31 31 3067 70481 32 32 2491 72972 33 33 2977 75949 34 34 3129 79078 35 35 2405 81483 36 36 1694 83177 37 37 4423 87600 38 38 1771 89371 39 39 1312 90683 40 40 1579 92262 41 41 1557 93819 42 42 1512 95331 43 43 1482 96813 44 44 1948 98761 45 45 1407 100168 46 46 1845 102013 47 47 2099 104112 48 48 1333 105445 49 49 1616 107061 50 50 883 107944 51 51 975 108919 52 52 1066 109985 53 53 867 110852 54 54 2820 113672 55 55 2157 115829 56 56 1970 117799 57 57 2345 120144 58 58 1315 121459 59 59 2339 123798 60 60 2308 126106 61 61 2025 128131 62 62 1545 129676 63 63 956 130632 64 64 743 131375 65 65 638 132013 66 66 498 132511 67 67 460 132971 68 68 404 133375 69 69 343 133718 70 70 360 134078 71 71 323 134401 72 72 260 134661 73 73 251 134912 74 74 223 135135 75 75 222 135357 76 76 206 135563 77 77 365 135928 78 78 352 136280 79 79 242 136522 80 80 276 136798 81 81 213 137011 82 82 188 137199 83 83 287 137486 84 84 272 137758 85 85 338 138096 86 86 254 138350 87 87 189 138539 88 88 213 138752 89 89 215 138967 90 90 218 139185 91 91 172 139357 92 92 136 139493 93 93 137 139630 94 94 179 139809 95 95 209 140018 96 96 494 140512 97 97 538 141050 98 98 330 141380 99 99 1888 143268 MC mate multiplicity combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 10263218 0 0 10263218 0 0 bin combo n cum label 1 1 11215 11215 Uniquely-aligned (U) 2 2 135418 146633 Multiply-aligned (M) 3 3 32734 179367 Filtered-out (F) 4 4 10083851 10263218 Unmapped (X) RC pair multiplicity combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 U-U 2 2 0 0 U-M 3 3 0 0 M-M 4 4 0 0 U-F 5 5 0 0 M-F 6 6 0 0 U-X 7 7 0 0 M-X 8 8 0 0 F-F 9 9 0 0 F-X 10 10 0 0 X-X LS local search TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 UU-LocalRescue 2 2 0 0 UM-LocalRescue 3 3 0 0 MM-LocalRescue 4 4 0 0 UU-localConsistance 5 5 0 0 UM-localConsistance 6 6 0 0 MM-localConsistance OC orientation combinations TOT MEAN STD IN OVER UNDER 0 0 0 0 0 0 bin combo n cum label 1 1 0 0 f1-f2 2 2 0 0 f1-r2 3 3 0 0 r1-f2 4 4 0 0 r1-r2 5 5 0 0 f2-f1 6 6 0 0 f2-r1 7 7 0 0 r2-f1 8 8 0 0 r2-r1