track name=deletions description="TopHat deletions"
chr10	3557548	3557549	-	1
chr10	4997900	4997901	-	1
chr10	4997908	4997909	-	1
chr10	4997921	4997923	-	1
chr10	5001237	5001238	-	1
chr10	52154919	52154921	-	1
chr10	52154948	52154949	-	1
chr10	56686669	56686670	-	1
chr10	66682691	66682692	-	1
chr10	79892614	79892615	-	1
chr10	85941900	85941901	-	1
chr10	96619535	96619536	-	1
chr10	97618987	97618988	-	1
chr10	97618992	97618993	-	1
chr10	97619002	97619003	-	1
chr10	97619007	97619008	-	1
chr10	120141826	120141827	-	1
chr10	128912273	128912274	-	1
chr11	16875092	16875093	-	1
chr11	16911760	16911761	-	1
chr11	29513169	29513170	-	1
chr11	53652256	53652257	-	1
chr11	53652259	53652260	-	1
chr11	53655589	53655590	-	1
chr11	53655622	53655624	-	1
chr11	53903544	53903545	-	1
chr11	72209766	72209767	-	1
chr11	72209773	72209774	-	2
chr11	74670684	74670685	-	4
chr11	74670700	74670701	-	1
chr11	74670760	74670761	-	3
chr11	74670781	74670782	-	1
chr11	74670789	74670790	-	1
chr11	74670811	74670812	-	1
chr11	74670817	74670818	-	1
chr11	74670833	74670834	-	2
chr11	75217636	75217637	-	3
chr11	79340024	79340025	-	1
chr11	79443902	79443903	-	1
chr11	79444121	79444122	-	1
chr11	79444715	79444716	-	1
chr11	79444741	79444742	-	1
chr11	79453874	79453875	-	3
chr11	79463245	79463246	-	1
chr11	79463275	79463276	-	2
chr11	79463286	79463287	-	1
chr11	79468770	79468771	-	1
chr11	79468781	79468782	-	1
chr11	79468802	79468803	-	1
chr11	79473406	79473407	-	1
chr11	79475833	79475834	-	1
chr11	79475861	79475862	-	1
chr11	79535700	79535701	-	1
chr11	79547765	79547766	-	1
chr11	79559438	79559439	-	1
chr11	79564845	79564846	-	1
chr11	79564863	79564864	-	1
chr11	79570390	79570391	-	1
chr11	80180145	80180146	-	1
chr11	98427052	98427053	-	1
chr11	98427058	98427059	-	1
chr11	98434826	98434828	-	1
chr11	98435341	98435342	-	1
chr11	98435996	98435997	-	1
chr11	98436541	98436542	-	2
chr11	99052615	99052616	-	1
chr11	100889518	100889519	-	1
chr11	100889523	100889524	-	1
chr11	100889525	100889527	-	1
chr11	100889531	100889532	-	1
chr11	100889533	100889534	-	1
chr11	100889537	100889538	-	1
chr11	100889542	100889543	-	3
chr11	100889549	100889550	-	14
chr11	100889555	100889556	-	1
chr11	100889557	100889558	-	1
chr11	100889568	100889569	-	1
chr11	100893931	100893932	-	1
chr11	100893938	100893939	-	1
chr11	100893951	100893952	-	1
chr11	100893956	100893957	-	2
chr11	100893965	100893966	-	1
chr11	100893968	100893969	-	1
chr11	100893978	100893979	-	1
chr11	100893980	100893981	-	4
chr11	100894750	100894751	-	1
chr11	100894779	100894780	-	1
chr11	100898656	100898657	-	1
chr11	100898664	100898665	-	1
chr11	100902755	100902756	-	1
chr11	100905231	100905232	-	1
chr11	103069661	103069662	-	1
chr11	103069712	103069713	-	1
chr11	116171892	116171893	-	1
chr11	117762404	117762405	-	2
chr11	117762552	117762553	-	1
chr12	69157745	69157746	-	1
chr12	112657720	112657721	-	2
chr12	112658642	112658643	-	1
chr12	112658674	112658675	-	1
chr12	112659172	112659173	-	1
chr12	113261328	113261329	-	1
chr12	113261333	113261334	-	1
chr12	113261338	113261339	-	1
chr12	113261343	113261344	-	1
chr12	113261348	113261349	-	1
chr12	113261353	113261354	-	1
chr13	40226105	40226106	-	1
chr13	66011957	66011958	-	1
chr13	98351908	98351909	-	1
chr13	98351913	98351914	-	1
chr13	98351923	98351924	-	1
chr13	98351928	98351929	-	1
chr14	20741530	20741531	-	1
chr14	24568244	24568245	-	1
chr14	31444053	31444054	-	1
chr14	79288781	79288782	-	1
chr14	97580174	97580175	-	2
chr15	26166609	26166610	-	1
chr15	39850153	39850154	-	1
chr15	58693446	58693447	-	1
chr15	98931562	98931563	-	1
chr16	15642853	15642854	-	1
chr16	15642853	15642855	-	1
chr16	55969636	55969637	-	1
chr16	62050489	62050491	-	1
chr16	81963821	81963822	-	1
chr17	43089135	43089136	-	1
chr17	68328929	68328930	-	1
chr17	71897869	71897870	-	1
chr17	71897881	71897882	-	1
chr17	71900776	71900777	-	1
chr17	71900802	71900803	-	1
chr17	71902615	71902616	-	1
chr17	71902640	71902641	-	1
chr17	71902651	71902652	-	1
chr17	71902654	71902655	-	1
chr17	71902713	71902714	-	1
chr17	71985495	71985496	-	1
chr17	72360678	72360679	-	3
chr17	72360696	72360697	-	1
chr17	87672658	87672659	-	1
chr17	87672773	87672774	-	4
chr17	87672780	87672781	-	1
chr17	87672795	87672796	-	2
chr17	87980331	87980332	-	2
chr17	87985398	87985399	-	1
chr18	11493273	11493274	-	1
chr18	46609044	46609045	-	1
chr18	46609108	46609109	-	1
chr18	46609112	46609113	-	1
chr18	46609127	46609128	-	1
chr18	64457336	64457337	-	1
chr18	64457469	64457470	-	1
chr18	73657206	73657207	-	1
chr18	73657220	73657221	-	1
chr18	73658617	73658618	-	3
chr18	73658686	73658687	-	1
chr18	73658836	73658837	-	3
chr18	77484396	77484397	-	2
chr19	6335476	6335477	-	1
chr19	6335838	6335839	-	1
chr19	6335869	6335870	-	1
chr19	6337488	6337489	-	1
chr19	6338843	6338844	-	1
chr19	6340011	6340012	-	1
chr19	6340059	6340060	-	1
chr19	6340064	6340065	-	1
chr19	6340071	6340072	-	1
chr19	6340089	6340090	-	1
chr19	6340100	6340101	-	1
chr19	9985031	9985032	-	1
chr19	32758009	32758010	-	3
chr19	32758417	32758418	-	72
chr19	32758423	32758424	-	2
chr19	32758433	32758434	-	4
chr19	32758444	32758445	-	1
chr19	32758449	32758450	-	2
chr19	32758466	32758467	-	1
chr19	32758469	32758470	-	1
chr19	32758476	32758477	-	2
chr19	32758480	32758481	-	3
chr19	32758503	32758504	-	1
chr19	32758512	32758513	-	3
chr19	32758519	32758520	-	1
chr19	32758530	32758531	-	14
chr19	32792536	32792537	-	1
chr19	32799918	32799919	-	2
chr19	32815517	32815518	-	2
chr19	32819972	32819973	-	1
chr19	34200039	34200040	-	1
chr19	43846843	43846844	-	1
chr1	9304735	9304737	-	1
chr1	44144189	44144190	-	1
chr1	44144207	44144208	-	1
chr1	52457681	52457682	-	1
chr1	68040172	68040173	-	1
chr1	68290257	68290258	-	4
chr1	68290269	68290270	-	2
chr1	68290272	68290273	-	1
chr1	68290276	68290277	-	2
chr1	68290281	68290282	-	12
chr1	68290285	68290286	-	5
chr1	68290295	68290296	-	1
chr1	68290296	68290297	-	1
chr1	68290304	68290305	-	1
chr1	68290308	68290309	-	1
chr1	68290316	68290317	-	1
chr1	68290325	68290326	-	3
chr1	68290333	68290334	-	1
chr1	68346630	68346631	-	3
chr1	98955922	98955923	-	1
chr1	106543342	106543344	-	1
chr1	106712348	106712349	-	1
chr1	114292843	114292844	-	1
chr1	132992161	132992162	-	1
chr1	170452742	170452743	-	1
chr1	172994707	172994708	-	1
chr1	172994712	172994713	-	1
chr1	172994717	172994718	-	1
chr1	172994722	172994723	-	1
chr1	172994727	172994728	-	1
chr1	172994732	172994733	-	1
chr1	182276251	182276252	-	1
chr1	182276271	182276272	-	1
chr2	26468359	26468360	-	1
chr2	26468551	26468552	-	1
chr2	26476416	26476417	-	1
chr2	26476426	26476427	-	2
chr2	26480233	26480234	-	1
chr2	26480306	26480307	-	1
chr2	26481064	26481065	-	1
chr2	64993980	64993982	-	1
chr2	126484390	126484391	-	1
chr2	164541498	164541499	-	1
chr3	32436423	32436424	-	1
chr3	32436431	32436432	-	2
chr3	32436437	32436438	-	1
chr3	32436443	32436444	-	1
chr3	32436448	32436449	-	23
chr3	32436468	32436469	-	1
chr3	32436485	32436486	-	5
chr3	32436496	32436497	-	9
chr3	32436501	32436502	-	2
chr3	32436506	32436507	-	1
chr3	32436512	32436513	-	3
chr3	32436530	32436531	-	1
chr3	32436533	32436534	-	4
chr3	32461794	32461795	-	1
chr3	41067502	41067503	-	1
chr3	41067555	41067556	-	1
chr3	90212731	90212732	-	1
chr3	103058933	103058934	-	1
chr3	103058948	103058949	-	1
chr3	103058953	103058954	-	1
chr3	103058973	103058974	-	1
chr3	103058980	103058981	-	22
chr3	103060266	103060267	-	1
chr3	126055180	126055181	-	1
chr3	135466633	135466634	-	1
chr3	135466659	135466660	-	1
chr3	135468048	135468049	-	1
chr3	135468176	135468177	-	1
chr3	147073254	147073255	-	1
chr4	5448920	5448921	-	1
chr4	19521181	19521182	-	1
chr4	54744940	54744941	-	3
chr4	57943960	57943961	-	1
chr4	64172908	64172909	-	1
chr4	95050329	95050330	-	1
chr4	95051085	95051086	-	1
chr4	131903071	131903072	-	1
chr4	134525737	134525738	-	1
chr4	148463782	148463783	-	1
chr4	148464408	148464409	-	1
chr4	148464411	148464412	-	1
chr4	148466032	148466033	-	1
chr4	148472104	148472105	-	1
chr4	148484769	148484770	-	1
chr4	148489569	148489570	-	1
chr4	148530529	148530530	-	1
chr4	148530533	148530534	-	1
chr4	148530543	148530544	-	2
chr4	148545573	148545574	-	1
chr5	3515480	3515481	-	1
chr5	25273682	25273683	-	1
chr5	25273728	25273729	-	1
chr5	25273735	25273736	-	1
chr5	25284387	25284388	-	1
chr5	25284809	25284810	-	1
chr5	25284812	25284813	-	1
chr5	25290596	25290597	-	2
chr5	25290607	25290608	-	1
chr5	25290614	25290615	-	2
chr5	25293143	25293144	-	1
chr5	25293158	25293159	-	1
chr5	25293266	25293267	-	145
chr5	25295563	25295565	-	1
chr5	25300327	25300328	-	1
chr5	25300377	25300378	-	1
chr5	25300394	25300395	-	1
chr5	25300402	25300403	-	1
chr5	25300405	25300406	-	1
chr5	25300411	25300412	-	1
chr5	25304646	25304647	-	8
chr5	25304652	25304653	-	210
chr5	25304652	25304654	-	2
chr5	25304677	25304678	-	1
chr5	25304690	25304691	-	1
chr5	25304705	25304706	-	1
chr5	25304734	25304735	-	1
chr5	25304752	25304753	-	1
chr5	25304761	25304762	-	2
chr5	25315859	25315860	-	1
chr5	25349881	25349882	-	1
chr5	25354436	25354437	-	1
chr5	25366118	25366119	-	1
chr5	25366143	25366144	-	1
chr5	25372826	25372827	-	1
chr5	25372842	25372843	-	1
chr5	25372854	25372855	-	1
chr5	25395529	25395530	-	1
chr5	25404287	25404288	-	1
chr5	25404302	25404303	-	1
chr5	25415012	25415013	-	1
chr5	25415039	25415040	-	1
chr5	36018109	36018110	-	1
chr5	56023197	56023199	-	1
chr5	64952151	64952152	-	1
chr5	68335601	68335603	-	1
chr5	75163617	75163618	-	1
chr5	75187947	75187948	-	1
chr5	75639154	75639155	-	1
chr5	75934533	75934534	-	1
chr5	99958287	99958288	-	1
chr5	100874159	100874160	-	1
chr5	100874164	100874165	-	1
chr5	100874174	100874175	-	1
chr5	100874179	100874180	-	1
chr5	110849650	110849651	-	1
chr5	110867009	110867010	-	1
chr5	114173105	114173106	-	3
chr5	133902798	133902799	-	1
chr5	142377122	142377123	-	1
chr6	4923982	4923984	-	1
chr6	8781053	8781055	-	1
chr6	17492064	17492065	-	1
chr6	17562211	17562212	-	1
chr6	17562232	17562233	-	2
chr6	17562237	17562238	-	1
chr6	35509084	35509085	-	1
chr6	39614159	39614160	-	1
chr6	39614259	39614261	-	1
chr6	39615786	39615787	-	1
chr6	39643109	39643111	-	1
chr6	39651759	39651760	-	1
chr6	39660973	39660974	-	2
chr6	39660979	39660980	-	2
chr6	39666255	39666256	-	1
chr6	39666283	39666284	-	1
chr6	39677389	39677390	-	2
chr6	39677414	39677415	-	1
chr6	39677422	39677423	-	3
chr6	53681028	53681029	-	1
chr6	67284119	67284120	-	1
chr6	101579342	101579344	-	1
chr6	118164767	118164768	-	1
chr6	118164774	118164775	-	1
chr6	118176340	118176341	-	1
chr6	134839021	134839022	-	1
chr6	145225136	145225137	-	2
chr6	145234267	145234268	-	6
chr6	145234273	145234274	-	2
chr6	145234278	145234279	-	1
chr6	145234280	145234281	-	1
chr6	145234283	145234284	-	1
chr6	145234291	145234292	-	2
chr6	145234299	145234300	-	2
chr6	145234303	145234304	-	1
chr6	145234338	145234339	-	1
chr6	145234346	145234347	-	1
chr6	145234347	145234348	-	1
chr6	145234357	145234358	-	1
chr6	145234358	145234359	-	1
chr6	145234379	145234380	-	2
chr6	145234384	145234385	-	1
chr6	145234389	145234390	-	2
chr6	145234401	145234402	-	1
chr6	145234406	145234407	-	1
chr6	145234408	145234409	-	1
chr6	145234416	145234417	-	1
chr6	145234423	145234424	-	3
chr6	145234425	145234426	-	1
chr6	145234430	145234431	-	1
chr6	145234431	145234432	-	3
chr6	145234433	145234434	-	1
chr6	145234438	145234439	-	1
chr6	145234444	145234445	-	2
chr7	3706871	3706872	-	1
chr7	34037367	34037368	-	1
chr7	80098130	80098131	-	2
chr7	91205408	91205409	-	2
chr7	108583825	108583827	-	1
chr7	111071946	111071947	-	1
chr7	111071969	111071970	-	1
chr7	111071976	111071977	-	1
chr7	111072055	111072056	-	1
chr7	123668782	123668784	-	1
chr7	127681243	127681244	-	1
chr7	127824544	127824545	-	3
chr7	130169811	130169813	-	1
chr7	130182675	130182676	-	1
chr7	130196145	130196146	-	1
chr7	130196183	130196184	-	1
chr7	130198465	130198466	-	1
chr7	130198515	130198516	-	1
chr7	130198524	130198525	-	1
chr7	130199767	130199768	-	1
chr7	130201067	130201068	-	1
chr7	130201068	130201069	-	4
chr7	130201080	130201081	-	24
chr7	130201085	130201086	-	2
chr7	130201093	130201094	-	5
chr7	130242485	130242486	-	2
chr7	130242510	130242511	-	1
chr7	130242512	130242514	-	1
chr7	130242513	130242514	-	1
chr7	130242532	130242533	-	1
chr7	130242652	130242653	-	2
chr7	140774859	140774860	-	1
chr8	13175286	13175287	-	1
chr8	13175314	13175315	-	1
chr8	25154765	25154766	-	1
chr8	25560745	25560746	-	1
chr8	25560772	25560773	-	1
chr8	25562237	25562238	-	1
chr8	25564321	25564322	-	1
chr8	25564333	25564334	-	1
chr8	25566903	25566904	-	2
chr8	25569747	25569748	-	1
chr8	39164967	39164968	-	1
chr8	83170731	83170732	-	1
chr8	85066988	85066989	-	1
chr8	85067004	85067005	-	1
chr8	90196828	90196829	-	1
chr8	110090892	110090893	-	1
chr8	110090897	110090898	-	2
chr8	110090953	110090954	-	1
chr8	110090957	110090958	-	2
chr8	110090980	110090981	-	1
chr8	110135316	110135317	-	1
chr9	35493188	35493189	-	1
chr9	36710406	36710407	-	1
chr9	53465281	53465282	-	1
chr9	53480629	53480630	-	1
chr9	61732019	61732020	-	1
chr9	61732024	61732025	-	1
chr9	61732029	61732030	-	1
chr9	61732034	61732035	-	1
chr9	61732039	61732040	-	1
chr9	61732044	61732045	-	1
chr9	68913989	68913991	-	1
chr9	74460054	74460055	-	1
chr9	99062893	99062894	-	1
chr9	99073650	99073651	-	1
chr9	108832757	108832758	-	1
chr9	119926485	119926486	-	1
chr9	119926534	119926535	-	1
chr9	120950978	120950979	-	1
chr9	120955407	120955409	-	1
chr9	120955465	120955466	-	1
chr9	120959369	120959370	-	1
chr9	120959399	120959400	-	1
chr9	120959434	120959435	-	1
chr9	120959441	120959442	-	1
chrM	11888	11889	-	1
chrM	11900	11901	-	1
chrM	15158	15159	-	1
chrM	15266	15267	-	2
chrX	13377634	13377635	-	1
chrX	37082628	37082629	-	1
chrX	87510344	87510346	-	1
chrX	98314958	98314959	-	2
chrX	98314981	98314982	-	1
chrX	98315888	98315889	-	1
chrX	98315904	98315905	-	1
chrX	98315910	98315911	-	1
chrX	98315945	98315946	-	2
chrX	101600997	101600998	-	1
chrX	133803534	133803535	-	1