##FastQC	0.11.8
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SPD4.s10q25.fastq.gz
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	828083
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	2-224
%GC	43
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	pass
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	26.935313247585086	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
2	26.738587798566087	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
3	26.714787392959835	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
4	26.82827354498377	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
5	26.856482191807302	27.0	26.0	28.0	23.0	30.0
6	26.880871136697337	27.0	26.0	28.0	23.0	30.0
7	26.94299266306068	27.0	26.0	28.0	23.0	30.0
8	26.93855437992126	27.0	26.0	28.0	23.0	30.0
9	26.979268342979694	27.0	26.0	28.0	23.0	30.0
10-14	27.09606003427794	27.0	26.0	29.0	23.0	30.0
15-19	27.042436338965036	27.0	26.0	28.2	23.0	30.0
20-24	26.962563776417426	27.0	26.0	28.0	23.0	29.4
25-29	26.8650550657405	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
30-34	26.8532214759309	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
35-39	26.849340920105398	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
40-44	26.838941712174535	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
45-49	26.78876377351794	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
50-54	26.785072564551417	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
55-59	26.78477625433417	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
60-64	26.786047011657804	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
65-69	26.767834373338747	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
70-74	26.77465978327269	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
75-79	26.786828622919053	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
80-84	26.803975229732213	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
85-89	26.80030275447074	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
90-94	26.811938736676318	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
95-99	26.803005667143417	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
100-104	26.836682143348686	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
105-109	26.852488894962228	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
110-114	26.86952928707542	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
115-119	26.848795202278	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
120-124	26.874144951349287	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
125-129	26.892702840669564	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
130-134	26.905655330847623	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
135-139	26.906468151394144	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
140-144	26.8807587269703	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
145-149	26.900938759031618	27.0	26.0	28.0	23.0	29.0
150-154	26.879943350087853	27.0	26.0	28.0	23.2	29.0
155-159	26.913187413429846	27.2	26.0	28.0	23.0	29.0
160-164	26.879757811468846	27.2	26.4	28.0	23.0	29.0
165-169	26.84760223279273	27.2	26.0	28.0	23.2	29.0
170-174	26.90215308492148	27.2	26.0	28.0	23.0	29.0
175-179	27.02995214768203	27.6	26.0	28.0	23.2	29.4
180-184	27.005214940098664	27.5	26.0	28.0	22.5	29.0
185-189	27.022753478266235	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
190-194	26.728926499183324	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
195-199	27.011715286741655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
200-204	26.80162393162393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
205-209	27.25181818181818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
210-214	27.133333333333333	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
215-219	26.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
220-224	27.6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	warn
#Quality	Count
24	712.0
25	101784.0
26	406284.0
27	294145.0
28	23086.0
29	1811.0
30	205.0
31	45.0
32	8.0
33	3.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	warn
#Base	G	A	T	C
1	24.07693431697064	22.14596845968339	14.619186724036117	39.15791049930985
2	17.36565054469178	24.058457908204854	37.26075767767241	21.315133869430962
3	15.31234414190951	26.74026690754604	33.50087008816813	24.446518862376323
4	19.15239990724996	30.22250347812645	30.500632825784514	20.12446378883908
5	19.60876461967992	32.10512517864974	28.91353171357569	19.37257848809465
6	19.5310958567505	29.550838297187276	30.907268631549893	20.010797214512326
7	20.984157663863993	29.302114421199715	29.18965038778183	20.524077527154468
8	19.216781496062993	27.435654527559056	31.670398622047248	21.677165354330707
9	20.508817953105062	26.398118303423573	31.10598416005419	21.987079583417174
10-14	21.242238909117727	28.176290464886954	28.577832166495032	22.003638459500287
15-19	21.64180400191304	28.285068037572586	28.35615984291615	21.71696811759822
20-24	21.655456079582063	28.254755811696768	28.079616692435504	22.010171416285665
25-29	21.796159471041957	28.31676680857867	28.197068679804193	21.69000504057518
30-34	21.959513451546712	28.06827555049655	27.780558003161026	22.191652994795703
35-39	22.101595034222544	28.2070049865801	27.943394803852563	21.748005175344797
40-44	22.283863972726337	27.733379315435098	27.671468911814895	22.311287800023667
45-49	22.2624763189993	28.05187390400065	27.836103377068266	21.849546399931786
50-54	22.339078383279716	27.59604227319154	27.705824723285694	22.35905462024305
55-59	22.453871858201367	27.609255708594148	27.761396213983012	22.175476219221473
60-64	22.543519841173765	27.428273975256033	27.514950487858027	22.513255695712175
65-69	22.684007826235717	27.660797948272663	27.658641564442092	21.996552661049527
70-74	22.457233595124674	27.235397622419637	27.81133856916012	22.49603021329557
75-79	22.70768230639942	27.56541470629985	27.55883157680352	22.168071410497213
80-84	22.745329836097874	27.203566195032447	27.608457398992698	22.44264656987698
85-89	22.59696956284395	27.485504359757446	27.961758066657815	21.95576801074079
90-94	22.605101155863913	27.260545658757124	27.638724995379388	22.49562818999957
95-99	22.370161627390907	27.70589071730503	28.224684048828617	21.699263606475437
100-104	22.50035677098474	27.50043605342579	27.838179252313726	22.16102792327574
105-109	22.253519281535972	27.96035608775113	28.152942178318995	21.6331824523939
110-114	22.737861190503725	28.056799220208497	27.430653075385354	21.774686513902427
115-119	22.362325477374625	28.078041299694352	28.25056709869115	21.309066124239877
120-124	22.645619436255647	27.99407502069386	27.77188829671367	21.588417246336824
125-129	21.808363334256438	28.417138109744034	28.44087510384935	21.333623452150178
130-134	22.18535722185357	28.129838531298386	27.69298827692988	21.99181596991816
135-139	22.49096905921156	27.882048060310975	28.145123291974244	21.48185958850322
140-144	22.489146164978294	27.837916063675834	27.86685962373372	21.80607814761216
145-149	22.411087866108787	27.763249651324966	28.774407252440724	21.051255230125523
150-154	22.575957727873185	28.124174372523118	27.397622192866578	21.90224570673712
155-159	22.579332790886898	28.132628152969897	28.173311635475994	21.114727420667208
160-164	23.67642222952976	27.162117724432754	27.984215718513646	21.17724432752384
165-169	23.819628647214856	28.912466843501328	26.153846153846157	21.114058355437663
170-174	22.63681592039801	28.938640132669985	27.860696517412936	20.563847429519072
175-179	21.262886597938145	25.257731958762886	33.24742268041237	20.2319587628866
180-184	22.44488977955912	29.258517034068138	28.256513026052104	20.04008016032064
185-189	23.174603174603174	26.031746031746035	29.20634920634921	21.58730158730159
190-194	27.43362831858407	23.451327433628318	30.08849557522124	19.02654867256637
195-199	22.30769230769231	27.692307692307693	25.384615384615383	24.615384615384617
200-204	20.0	30.666666666666664	22.666666666666664	26.666666666666668
205-209	27.77777777777778	38.88888888888889	22.22222222222222	11.11111111111111
210-214	21.428571428571427	21.428571428571427	35.714285714285715	21.428571428571427
215-219	20.0	40.0	40.0	0.0
220-224	0.0	40.0	40.0	20.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	pass
#GC Content	Count
0	1030.0
1	1030.0
2	1039.5
3	1158.5
4	1533.5
5	2409.5
6	3596.5
7	4533.5
8	5236.5
9	5725.0
10	6155.5
11	6707.0
12	7293.0
13	8284.0
14	9744.5
15	11853.5
16	13550.5
17	15186.5
18	17335.0
19	20057.5
20	22436.0
21	25185.5
22	28279.0
23	31597.0
24	35065.5
25	39862.5
26	45209.5
27	48643.5
28	53622.5
29	59222.0
30	64144.0
31	69745.33333333333
32	76158.16666666666
33	81746.0
34	87303.5
35	93670.83333333334
36	99453.0
37	103768.66666666666
38	107972.33333333333
39	112218.5
40	114839.5
41	116194.33333333334
42	116670.5
43	116092.33333333333
44	114276.16666666667
45	111310.5
46	107350.16666666667
47	103116.0
48	98634.83333333333
49	94796.33333333333
50	87028.5
51	79327.5
52	76078.0
53	71762.83333333334
54	66341.33333333334
55	60406.5
56	55157.333333333336
57	51165.16666666667
58	47131.0
59	42640.0
60	39472.166666666664
61	36166.83333333333
62	33094.0
63	30396.5
64	27147.5
65	23793.5
66	21017.5
67	19861.0
68	18051.833333333336
69	15510.0
70	13743.0
71	12374.0
72	10856.5
73	9579.5
74	8842.5
75	7392.0
76	6052.0
77	5444.0
78	4854.5
79	4113.0
80	3460.5
81	2989.5
82	2488.5
83	2158.5
84	1889.5
85	1636.0
86	1309.5
87	1185.5
88	1056.5
89	920.0
90	838.0
91	761.5
92	673.5
93	528.5
94	367.5
95	198.5
96	105.5
97	90.0
98	87.0
99	87.0
100	87.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10-14	0.0
15-19	0.0
20-24	0.0
25-29	0.0
30-34	0.0
35-39	0.0
40-44	0.0
45-49	0.0
50-54	0.0
55-59	0.0
60-64	0.0
65-69	0.0
70-74	0.0
75-79	0.0
80-84	0.0
85-89	0.0
90-94	0.0
95-99	0.0
100-104	0.0
105-109	0.0
110-114	0.0
115-119	0.0
120-124	0.0
125-129	0.0
130-134	0.0
135-139	0.0
140-144	0.0
145-149	0.0
150-154	0.0
155-159	0.0
160-164	0.0
165-169	0.0
170-174	0.0
175-179	0.0
180-184	0.0
185-189	0.0
190-194	0.0
195-199	0.0
200-204	0.0
205-209	0.0
210-214	0.0
215-219	0.0
220-224	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
0-4	346.0
5-9	43678.0
10-14	116328.0
15-19	82792.0
20-24	74702.0
25-29	66718.0
30-34	59036.0
35-39	51297.0
40-44	46385.0
45-49	41548.0
50-54	36663.0
55-59	32020.0
60-64	27637.0
65-69	23879.0
70-74	20662.0
75-79	17286.0
80-84	14245.0
85-89	12263.0
90-94	10492.0
95-99	9013.0
100-104	7853.0
105-109	6660.0
110-114	5703.0
115-119	5206.0
120-124	4304.0
125-129	3038.0
130-134	2527.0
135-139	1743.0
140-144	1394.0
145-149	882.0
150-154	619.0
155-159	438.0
160-164	270.0
165-169	175.0
170-174	97.0
175-179	67.0
180-184	39.0
185-189	28.0
190-194	16.0
195-199	16.0
200-204	7.0
205-209	8.0
210-214	2.0
215-219	0.0
220-224	1.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	97.5853912241359
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	98.15438062737178	95.78433633884819
2	1.4939765219098102	2.915805667404853
3	0.21787181057998156	0.6378331761647499
4	0.07159280904279954	0.27945649117105786
5	0.029729967381678612	0.1450605249010953
6	0.013814553776938089	0.08088591809456205
7	0.006472537735868957	0.044213758901742846
8	0.004825456349454086	0.03767152365571741
9	0.0027153469787907832	0.02384803775111166
>10	0.004620368872904681	0.05088856310690475
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
3	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	0.0
4	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
5	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
6	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
7	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
8	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
9	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
10-14	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
15-19	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
20-24	0.0	0.0	1.2076084160645732E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
25-29	0.0	0.0	1.6906517824904024E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
30-34	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
35-39	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	0.0	1.2076084160645732E-4
40-44	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	7.24565049638744E-5	1.2076084160645732E-4
45-49	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
50-54	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
55-59	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
60-64	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
65-69	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
70-74	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
75-79	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
80-84	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
85-89	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
90-94	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
95-99	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
100-104	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
105-109	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
110-114	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
115-119	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
120-124	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
125-129	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
130-134	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
135-139	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
140-144	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
145-149	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
150-154	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
155-159	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
160-164	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
165-169	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
170-174	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
175-179	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
180-184	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
185-189	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
190-194	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
195-199	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
200-204	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
205-209	0.0	0.0	2.4152168321291465E-4	1.2076084160645732E-4	1.2076084160645732E-4
210-213	0.0	0.0	2.71711893614529E-4	1.5095105200807165E-4	1.5095105200807165E-4
>>END_MODULE
