##FastQC	0.11.8
>>Basic Statistics	pass
#Measure	Value
Filename	SPD4.fastq
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	1444924
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	25-387
%GC	42
>>END_MODULE
>>Per base sequence quality	warn
#Base	Mean	Median	Lower Quartile	Upper Quartile	10th Percentile	90th Percentile
1	25.097364982518112	27.0	23.0	28.0	20.0	29.0
2	24.614640631617995	26.0	23.0	28.0	19.0	29.0
3	24.415834327618615	26.0	23.0	28.0	18.0	29.0
4	24.36213807785046	26.0	23.0	28.0	17.0	29.0
5	24.26546378909894	26.0	22.0	28.0	16.0	29.0
6	24.269762977153125	26.0	22.0	28.0	16.0	29.0
7	24.345290132906644	26.0	22.0	28.0	16.0	29.0
8	24.369168205386583	26.0	22.0	28.0	16.0	29.0
9	24.47589631011735	26.0	23.0	28.0	17.0	29.0
10-19	24.874980898649344	26.6	23.0	28.0	19.3	29.0
20-29	24.84283679870861	26.3	23.0	28.0	19.5	29.0
30-39	24.632301566405346	26.0	23.0	28.0	19.0	29.0
40-49	24.42389297127792	26.0	22.7	28.0	18.3	29.0
50-59	24.180372331971256	25.8	22.0	27.6	17.6	28.3
60-69	23.982201445719078	25.0	22.0	27.0	16.9	28.0
70-79	23.818615137610575	25.0	22.0	27.0	16.0	28.0
80-89	23.71467650917571	25.0	22.0	27.0	16.0	28.0
90-99	23.64829116305851	25.0	21.3	27.0	16.0	28.0
100-109	23.609912175846734	25.0	21.0	27.0	16.0	28.0
110-119	23.60157597120289	25.0	21.0	27.0	16.0	28.0
120-129	23.58926024426148	25.0	21.0	27.0	16.0	28.0
130-139	23.560818190375926	25.0	21.0	27.0	16.0	28.0
140-149	23.49128563896198	25.0	21.0	27.0	16.0	28.0
150-159	23.404475376861853	25.0	21.0	27.0	16.0	28.0
160-169	23.30849908083931	24.3	21.0	27.0	15.7	28.0
170-179	23.172421446610038	24.0	21.0	27.0	15.0	28.0
180-189	22.995483549272727	24.0	20.6	27.0	14.6	28.0
190-199	22.794383270747886	24.0	20.0	27.0	14.0	28.0
200-209	22.541324406692787	23.6	20.0	27.0	14.0	28.0
210-219	22.30901865814176	23.0	20.0	26.6	13.8	28.0
220-229	22.095424620396425	23.0	19.6	26.0	13.0	28.0
230-239	21.874475590596084	23.0	19.0	26.0	13.0	28.0
240-249	21.636096232517133	23.0	19.0	26.0	13.0	27.3
250-259	21.376504359004144	22.2	18.6	25.5	12.9	27.0
260-269	21.041898505659077	22.0	18.0	25.0	12.0	27.0
270-279	20.68953948956739	22.0	17.4	25.0	12.0	27.0
280-289	20.3754894488631	21.5	16.8	25.0	12.0	27.0
290-299	20.105417247622885	21.0	15.8	24.9	12.0	27.0
300-309	19.755240953162982	21.0	15.3	24.1	11.7	27.0
310-319	19.680595838262107	20.4	15.4	24.0	11.4	26.9
320-329	19.476980268182622	20.444444444444443	14.88888888888889	23.77777777777778	10.666666666666666	26.555555555555557
330-339	20.305097354638907	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
340-349	20.330426865618044	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
350-359	20.477082362082363	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
360-369	24.31134920634921	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
370-379	14.725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
380-387	5.0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
>>END_MODULE
>>Per sequence quality scores	warn
#Quality	Count
12	1.0
13	2.0
14	102.0
15	1549.0
16	6115.0
17	16343.0
18	32354.0
19	51807.0
20	73945.0
21	101549.0
22	138712.0
23	191884.0
24	261126.0
25	309787.0
26	228286.0
27	31283.0
28	79.0
>>END_MODULE
>>Per base sequence content	warn
#Base	G	A	T	C
1	24.628215740066604	20.78150823157481	16.807735216523497	37.782540811835084
2	17.900664671636708	24.22203520738807	36.305992564314806	21.571307556660418
3	14.567894228346958	27.373896481752674	34.39530383604951	23.66290545385086
4	18.08205829510756	30.76431701598146	31.15707123696471	19.996553451946262
5	18.81967494484139	32.623791977986386	29.47352248284339	19.083010594328837
6	18.838084217578224	30.339173548228143	31.30808263964056	19.51465959455307
7	20.195733478023758	29.779213301184004	30.021925028582817	20.003128192209417
8	18.711433957772172	27.85274519628714	32.21643491283971	21.21938593310098
9	20.000498296104155	27.013254676370522	31.534530535862093	21.451716491663227
10-19	20.838016393941828	29.08081670731471	28.729981646093496	21.351185252649966
20-29	21.023735933068906	29.067000361587493	28.41285256512385	21.496411140219752
30-39	21.206925984329406	29.134408418892775	28.153564439755606	21.505101157022207
40-49	21.410179627815353	28.991852671971614	28.031361126381398	21.56660657383163
50-59	21.52547435835306	28.909372176736635	27.914710164467515	21.650443300442788
60-69	21.683142004987545	28.909933113500667	27.789569897638067	21.617354983873714
70-79	21.670964087472335	28.92210660152007	27.805238074500142	21.60169123650745
80-89	21.665455729771782	29.004375619400836	27.835037523930644	21.49513112689674
90-99	21.665397864896175	29.169162654134794	27.79977893854709	21.365660542421942
100-109	21.57604997229596	29.349888781494315	27.86874515677068	21.20531608943904
110-119	21.517870037665883	29.617381677827854	27.86213043082903	21.002617853677233
120-129	21.407726252951914	29.827857858177136	27.905124388598274	20.859291500272672
130-139	21.345550638078457	30.066281347031914	27.86830006309548	20.71986795179415
140-149	21.302009731899936	30.201807017148223	27.89803734143308	20.598145909518763
150-159	21.251848315236646	30.330767493655586	27.928786762983478	20.48859742812429
160-169	21.13787923852066	30.379561197251732	28.069047178123093	20.413512386104518
170-179	21.035014709429014	30.498452561693014	28.1405879309374	20.325944797940572
180-189	20.930401880109258	30.590431468861627	28.168912594585304	20.31025405644381
190-199	20.750233937838477	30.706251530801293	28.264715056385825	20.278799474974406
200-209	20.73791861721282	30.72337054375225	28.352898811667266	20.185812027367664
210-219	20.586030226494238	30.83854082485108	28.386070341542634	20.189358607112048
220-229	20.474012044144633	30.871778966684758	28.48285130908997	20.17135768008064
230-239	20.35512077229094	31.019266540848058	28.389634899729803	20.235977787131198
240-249	20.52050094660777	31.0202920707156	28.329348396099796	20.129858586576834
250-259	20.563373740188563	31.003553016580742	28.410779805861313	20.022293437369374
260-269	20.38396299151889	30.953739398612186	28.605242868157287	20.057054741711642
270-279	20.52256838171333	31.08562346295521	28.514664347004302	19.87714380832716
280-289	20.68812101438529	31.298301118855772	28.50033779886961	19.513240067889335
290-299	20.68200397057106	31.563120401728366	28.322433726497724	19.43244190120285
300-309	20.653359861369616	32.56530389577049	27.30890186765933	19.472434375200564
310-319	20.965540771067896	33.04332992152849	26.56090071647902	19.4302285909246
320-329	19.4585448392555	33.95375070501974	26.67794698251551	19.90975747320925
330-339	16.898608349900595	37.77335984095427	21.669980119284293	23.658051689860834
340-349	22.448979591836736	29.591836734693878	24.489795918367346	23.46938775510204
350-359	10.576923076923077	26.923076923076923	34.61538461538461	27.884615384615387
360-369	18.333333333333332	30.0	30.0	21.666666666666668
370-379	30.555555555555557	25.0	16.666666666666664	27.77777777777778
380-387	25.0	25.0	25.0	25.0
>>END_MODULE
>>Per sequence GC content	warn
#GC Content	Count
0	0.0
1	2.0
2	6.5
3	8.5
4	7.5
5	10.0
6	17.0
7	22.0
8	26.5
9	44.0
10	72.5
11	100.5
12	137.5
13	183.0
14	221.0
15	263.0
16	328.33333333333337
17	437.0
18	613.3333333333333
19	829.5
20	1052.5833333333335
21	1353.8333333333333
22	1820.3333333333323
23	2465.666666666666
24	3315.9166666666706
25	4343.916666666675
26	5704.250000000001
27	7610.583333333294
28	10173.833333333341
29	13469.916666666815
30	17464.000000000244
31	22148.583333333114
32	27999.08333333255
33	34599.08333333208
34	41836.66666666728
35	49401.083333335846
36	57217.000000004475
37	64636.5000000062
38	71066.41666667
39	76577.50000000093
40	80428.74999999885
41	82581.24999999849
42	83168.4166666651
43	81336.41666666543
44	77474.08333333326
45	72565.91666666818
46	66919.66666666971
47	60232.000000002496
48	53054.250000001404
49	46562.750000000786
50	40516.16666666684
51	34786.99999999955
52	29816.249999999487
53	25857.16666666636
54	22326.24999999991
55	19177.333333333383
56	16680.500000000215
57	14588.500000000158
58	12782.583333333418
59	11265.500000000045
60	10104.75000000001
61	9066.083333333305
62	7979.666666666612
63	7065.333333333294
64	6329.499999999982
65	5593.24999999999
66	4823.083333333337
67	4152.333333333347
68	3419.0000000000095
69	2748.0833333333358
70	2286.9999999999986
71	1919.749999999998
72	1529.583333333333
73	1089.1666666666672
74	809.1666666666669
75	582.0000000000001
76	375.99999999999994
77	272.16666666666663
78	186.33333333333331
79	113.16666666666667
80	76.0
81	55.5
82	36.5
83	25.0
84	19.0
85	14.0
86	13.0
87	10.0
88	6.0
89	3.5
90	3.0
91	2.0
92	1.0
93	1.0
94	0.5
95	0.0
96	0.0
97	0.0
98	0.0
99	0.0
100	0.0
>>END_MODULE
>>Per base N content	pass
#Base	N-Count
1	0.0
2	0.0
3	0.0
4	0.0
5	0.0
6	0.0
7	0.0
8	0.0
9	0.0
10-19	0.0
20-29	0.0
30-39	0.0
40-49	0.0
50-59	0.0
60-69	0.0
70-79	0.0
80-89	0.0
90-99	0.0
100-109	0.0
110-119	0.0
120-129	0.0
130-139	0.0
140-149	0.0
150-159	0.0
160-169	0.0
170-179	0.0
180-189	0.0
190-199	0.0
200-209	0.0
210-219	0.0
220-229	0.0
230-239	0.0
240-249	0.0
250-259	0.0
260-269	0.0
270-279	0.0
280-289	0.0
290-299	0.0
300-309	0.0
310-319	0.0
320-329	0.0
330-339	0.0
340-349	0.0
350-359	0.0
360-369	0.0
370-379	0.0
380-387	0.0
>>END_MODULE
>>Sequence Length Distribution	warn
#Length	Count
20-29	6605.0
30-39	15316.0
40-49	17274.0
50-59	19786.0
60-69	22218.0
70-79	26067.0
80-89	34620.0
90-99	57772.0
100-109	96337.0
110-119	159825.0
120-129	191506.0
130-139	191494.0
140-149	164858.0
150-159	128857.0
160-169	93189.0
170-179	64520.0
180-189	44560.0
190-199	30450.0
200-209	21257.0
210-219	14716.0
220-229	10644.0
230-239	7804.0
240-249	5889.0
250-259	4654.0
260-269	3841.0
270-279	3414.0
280-289	2944.0
290-299	2263.0
300-309	1353.0
310-319	604.0
320-329	200.0
330-339	60.0
340-349	14.0
350-359	4.0
360-369	5.0
370-379	3.0
380-388	1.0
>>END_MODULE
>>Sequence Duplication Levels	pass
#Total Deduplicated Percentage	95.31764564015957
#Duplication Level	Percentage of deduplicated	Percentage of total
1	95.71312857492362	91.23150072615601
2	3.8279775185803797	7.2974760926908395
3	0.36355439698395775	1.0395944754791637
4	0.0658687020625176	0.251137984078892
5	0.015796820488642675	0.07528578687888274
6	0.006301501692190808	0.03603865831782656
7	0.002239668288051653	0.014943593576240722
8	0.002199682003482959	0.016773480778321994
9	4.6727433894715983E-4	0.004008554087085467
>10	0.0024658606382010066	0.03324064795676155
>50	0.0	0.0
>100	0.0	0.0
>500	0.0	0.0
>1k	0.0	0.0
>5k	0.0	0.0
>10k+	0.0	0.0
>>END_MODULE
>>Overrepresented sequences	pass
>>END_MODULE
>>Adapter Content	pass
#Position	Illumina Universal Adapter	Illumina Small RNA 3' Adapter	Illumina Small RNA 5' Adapter	Nextera Transposase Sequence	SOLID Small RNA Adapter
1	0.0	6.920779224374431E-5	0.0	0.0	0.0
2	0.0	6.920779224374431E-5	0.0	0.0	0.0
3	0.0	6.920779224374431E-5	6.920779224374431E-5	0.0	0.0
4	0.0	6.920779224374431E-5	6.920779224374431E-5	0.0	6.920779224374431E-5
5	0.0	6.920779224374431E-5	6.920779224374431E-5	0.0	6.920779224374431E-5
6	0.0	6.920779224374431E-5	6.920779224374431E-5	0.0	1.3841558448748862E-4
7	0.0	6.920779224374431E-5	6.920779224374431E-5	0.0	1.3841558448748862E-4
8	0.0	6.920779224374431E-5	6.920779224374431E-5	0.0	1.3841558448748862E-4
9	0.0	6.920779224374431E-5	6.920779224374431E-5	0.0	1.3841558448748862E-4
10-19	1.3841558448748862E-5	6.920779224374431E-5	9.689090914124203E-5	2.7683116897497723E-5	1.3841558448748862E-4
20-29	1.0381168836561647E-4	6.920779224374431E-5	2.2146493517998179E-4	6.920779224374431E-5	1.3841558448748862E-4
30-39	1.3841558448748862E-4	6.920779224374431E-5	2.7683116897497725E-4	6.920779224374431E-5	1.3841558448748862E-4
40-49	1.3841558448748862E-4	6.920779224374431E-5	3.1143506509684945E-4	1.2457402603873976E-4	1.3841558448748862E-4
50-59	1.3841558448748862E-4	1.4533636371186304E-4	4.0140519501371695E-4	1.3841558448748862E-4	1.3841558448748862E-4
60-69	1.3841558448748862E-4	2.0762337673123295E-4	4.152467534624659E-4	1.3841558448748862E-4	1.7301948060936077E-4
70-79	1.3841558448748862E-4	2.0762337673123295E-4	4.152467534624659E-4	1.3841558448748862E-4	2.0762337673123295E-4
80-89	1.3841558448748862E-4	2.2146493517998179E-4	4.152467534624659E-4	1.3841558448748862E-4	2.4222727285310507E-4
90-99	2.5606883130185393E-4	2.7683116897497725E-4	5.190584418280823E-4	1.8686103905810964E-4	2.9067272742372614E-4
100-109	2.7683116897497725E-4	3.1143506509684945E-4	6.228701301936988E-4	2.491480520774795E-4	3.460389612187216E-4
110-119	2.7683116897497725E-4	3.9448441578934253E-4	6.228701301936988E-4	2.7683116897497725E-4	3.460389612187216E-4
120-129	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4	6.228701301936988E-4	2.7683116897497725E-4	3.460389612187216E-4
130-139	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4	6.436324678668222E-4	2.7683116897497725E-4	3.6680129889184485E-4
140-149	3.1143506509684945E-4	4.152467534624659E-4	7.889688315786851E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
150-159	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
160-169	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
170-179	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
180-189	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
190-199	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
200-209	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
210-219	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
220-229	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
230-239	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
240-249	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
250-259	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
260-269	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
270-279	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
280-289	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
290-299	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
300-309	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
310-319	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
320-329	3.460389612187216E-4	4.152467534624659E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
330-339	3.460389612187216E-4	4.706129872574613E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
340-349	3.460389612187216E-4	4.8445454570621014E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.152467534624659E-4
350-359	3.460389612187216E-4	5.536623379499545E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.8445454570621014E-4
360-369	3.460389612187216E-4	5.536623379499545E-4	8.304935069249318E-4	2.7683116897497725E-4	4.8445454570621014E-4
370-376	3.559257886821136E-4	5.635491654133464E-4	8.403803343883237E-4	2.867179964383693E-4	4.943413731696022E-4
>>END_MODULE
