#macs2 callpeak -t Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30.bam -n Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30_nolambda_nomodel_new2 --format BAMPE --gsize 2451960000 --bw=300 --nolambda --ratio 1.0 --slocal 1000 --llocal 10000 --keep-dup all --qvalue 0.05 --tsize 100 --shift -100 --extsize 200 #MACS2 -t /home/galaxy/galaxy/database/files/000/dataset_33.dat --format BAMPE --gsize 2451960000 --bw=300 --nolambda --ratio 1.0 --slocal 1000 --llocal 10000 --keep-dup all --qvalue 0.05 macs2 callpeak -t Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30.bam -n Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30_nolambda_nomodel --nomodel --nolambda --tsize 100 --shift -100 --extsize 200 --keep-dup all -q 0.05 macs2 callpeak -t gDNA.MPS12301184-A01.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30.bam -n gDNA.MPS12301184-A01.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30_nolambda_nomodel --nomodel --nolambda --tsize 100 --shift -100 --extsize 200 --keep-dup all -q 0.05 macs2 callpeak -t Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30.bam -n Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30_nolambda_nomodel_pv0.05 --nomodel --nolambda --tsize 100 --shift -100 --extsize 200 --keep-dup all -p 0.05 macs2 callpeak -t gDNA.MPS12301184-A01.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30.bam -n gDNA.MPS12301184-A01.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30_nolambda_nomodel_pv0.05 --nomodel --nolambda --tsize 100 --shift -100 --extsize 200 --keep-dup all -p 0.05 macs2 callpeak -t Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30.bam -n Nuclei.MPS12301184-A02.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30_nolambda_nomodel_pv0.00001 --nomodel --nolambda --tsize 100 --shift -100 --extsize 200 --keep-dup all -p 0.00001 macs2 callpeak -t gDNA.MPS12301184-A01.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30.bam -n gDNA.MPS12301184-A01.2907.8_mapped_without_chrM.markedDuplicates.MAPQ30_nolambda_nomodel_pv0.00001 --nomodel --nolambda --tsize 100 --shift -100 --extsize 200 --keep-dup all -p 0.00001