Pairwise Align DNA results
Alignment results for 1124 residue sequence "mm10_dna range=chr14:78277452-78278575 5'pad=0 3'pad=0 strand=- repeatMasking=none" starting "GACTCATTTC"
and 1092 residue sequence "hg19_dna range=chr13:43181062-43182153 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none" starting "TTTTTGGAGT"

>mm10_dna range=chr14:78277452-78278575 5'pad=0 3'pad=0 strand=- repeatMasking=none
GACTCATTTCGTGGAACATTAGCATGGATGTCCTAGATGTTTGGAAAC--TTCTT-AAA-
AA---ATGGATGATGTCTATACATGTGTAAGACTACTAAGAGACATGG-CCC-ACGGTGT
ATGAAACTCA-CAGCCCTCTCTCTTGAGCCTGTACAG--GTTGTGTATATGTAAAGTCCA
-TAGGTGATGTTAGATTCATGGTG-ATTACACAACGG-TTTTACAATTTTGTAATGATTT
CCTAGAATTGAACCAGATTGGGAG-AGGTATTCCGATG--CTTATGAAAAACTTACACGT
GAGCTATGGAAGGGGGTCACAGTCTCTGGGTCTAACCCCTGGACATGTGCCACTGAGAAC
CTTGAAATTAAGAGGATGCCATGTCATTGCAA-AGAAATGAT-AGTGTGAAGGGTTAAGT
TCTTTTGAATTGTTACATTGCGCTGGGACCTGCAAATAAGTTCTTTTTTTCTAATGAGGA
GAGAAAAATATATGTATTTTTATATAATGTCTAAAGTTATATTTCAGGTGTAATGTTTTC
TGTGCAAAGTTTTGTAAATTATATTTGTGCTATAGTATTTGATTCAAAATATTTAAAAAT
GTCTCACTGTTGACATATTTAATGTTTTAAATGTACAGATGTATTTAACTGGTGCACTTT
GT-AATTCCCCTGAAG-GTACTCGTAGCTAA-G-GGGG--CAGAATACTGTTT-CTGGTG
ACCACATGTAGTTTATTTCTTTATTCTTTTTAACTTAATAGA-GTCTTCAGACTTGTCAA
AACTATGCAAGCAAAATAAATAAATAAAAATAAAATGAATACCTTGAATAATAAGTAGGA
TGTTGGTCACCAGGTGCCTTTCAAATTTAGAAGCTAATTGACTTTAG-GAGCTGACATAG
CCAAAAAGGATACATAATAGGCTACTGAAATCTGTCAGGAGTATTTATGCAATTATTGAA
CAGGTGTCTTTTTTTACAAGAGCTACAAATTGTAAATTTTGTTTCTTTTTTTTCCCATAG
AAAA-TGTACTA-TAGTTTATCAGCCAAAAAACAATCCACTTTTTAATTTAGTGAAAGTT
ATTTTATTATACTGTACAATAAAAGCATTGTCTCTGAATGTTAATTTTTTGGTACAAAAA
ATAAATTTGTACGAA-----------

>hg19_dna range=chr13:43181062-43182153 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none
------TTTT-TGGAGTGTTA---TGTATTTCCTGGATGTTTGGAAACATTTTTTAAAAC
AAGCCAAGAAAGATGTATATAGGTGTGTGAGACTACTAAGAGGCATGGCCCCAACGGTAC
ACGA--CTCAGTATCCATG-CTCTTGACCTTGTAGAGAACACGCGTAT-T-TACAG-CCA
GTGGGAGATGTTAGACTCATGGTGTGTTACACAATGGTTTTTA-AATTTTGTAATGAATT
CCTAGAATTAAACCAGATTGG-AGCAATTACGGGG-TGACCTTATGAGAAACTG-CATGT
GGGCTATGGGAGGGG-T-----T----GG-TC---CC--TGGTCATGTGCCCCTTCGCAG
CT-GAAGTGGAGAGGGTGTCATCT-AGCGCAATTGAAG-GATCA-TCTGAAGGGGCAAAT
TCTTTTGAATTGTTACATCATGCTGGAACCTGCAAAAAA-TACTTTTT--CTAATGAGGA
GAGAAAA-TATATGTATTTTTATATAATATCTAAAGTTATATTTCAGATGTAATGTTTTC
TTTGCAAAGTATTGTAAATTATATTTGTGCTATAGTATTTGATTCAAAATATTTAAAAAT
GTCTTGCTGTTGACATATTTAATGTTTTAAATGTACAGACATATTTAACTGGTGCACTTT
GTAAATTCCC-TGGGGAAAACTTGCAGCTAAGGAGGGGAAAAAAATGTTGTTTCCTAAT-
ATCAAATGCAGTATATTTCTTCGTTCTTTTTAAGTTAATAGATTTTTTCAGACTTGTCAA
GCCTGTGCAA--AAAA-A--T---TAAAA-TGGA-TG----CCTTGAATAATAAGCAGGA
TGTTGGCCACCAGGTGCCTTTCAAATTTAGAAACTAATTGACTTTAGAAAGCTGACATTG
CCAAAAAGGATACATAATGGGCCACTGAAATCTGTCAAGAGTAGTTATATAATTGTTGAA
CAGGTGT-TTTTCC-ACAAGTGCCGCAAATTGTACCTTTT-TTG-TTTTTTCAAA-ATAG
AAAAGT-TATTAGTGGTTTATCAGC-AAAAAAG--TCCAATTTT-AATTTAGTAAATGTT
ATCTTAT-A--CTGTACAATAAAAACATTGCCTTTGAATGTTAATTTTTTGGTACAAAAA
-TAAATTTATATGAAAACCTGCCTTG

Alignment score: 1467