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I identified a total of 2889842 reads mapping to 1187323 Unique genomic coordinates Making up 14242 groups Consisting of 10336 clusters Running PARalyzer v1.1 Parsing bowtie file(s)...nr 500000 chr ENSMUST00000133941 l18 e 1 nr 1000000 chr ENSMUST00000162211 l18 e 1 nr 1500000 chr ENSMUST00000160091 l18 e 1 nr 2000000 chr ENSMUST00000123881 l18 e 1 nr 2500000 chr ENSMUST00000142921 l18 e 1 nr 3000000 chr ENSMUST00000145331 l18 e 1 nr 3500000 chr ENSMUST00000167911 l18 e 1 nr 4000000 chr ENSMUST00000133761 l18 e 1 nr 4500000 chr ENSMUST00000170531 l18 e 1 nr 5000000 chr ENSMUST00000147321 l18 e 1 nr 5500000 chr ENSMUST00000173931 l18 e 1 nr 6000000 chr ENSMUST00000163181 l18 e 1 nr 6500000 chr ENSMUST00000153001 l18 e 1 nr 7000000 chr ENSMUST00000126401 l18 e 1 nr 7500000 chr ENSMUST00000150771 l18 e 1 nr 8000000 chr ENSMUST00000131491 l18 e 1 nr 8500000 chr ENSMUST00000146781 l18 e 1 nr 9000000 chr ENSMUST00000125921 l18 e 1 nr 9500000 chr ENSMUST00000151201 l18 e 1 nr 10000000 chr ENSMUST00000164091 l18 e 1 nr 10500000 chr ENSMUST00000127491 l18 e 1 nr 11000000 chr ENSMUST00000133001 l18 e 1 nr 11500000 chr ENSMUST00000136871 l18 e 1 nr 12000000 chr ENSMUST00000151911 l18 e 1 Done Creating Read Groups & Clusters...Done Sorting Groups...Done Generating Output...Done! 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I identified a total of 3156715 reads mapping to 1171783 Unique genomic coordinates Making up 13986 groups Consisting of 10184 clusters Running PARalyzer v1.1 Parsing bowtie file(s)...nr 500000 chr ENSMUST00000132228 l18 e 8 nr 1000000 chr ENSMUST00000137868 l18 e 8 nr 1500000 chr ENSMUST00000137868 l18 e 8 nr 2000000 chr ENSMUST00000167528 l18 e 8 nr 2500000 chr ENSMUST00000159698 l18 e 8 nr 3000000 chr ENSMUST00000138058 l18 e 8 nr 3500000 chr ENSMUST00000144778 l18 e 8 nr 4000000 chr ENSMUST00000152598 l18 e 8 nr 4500000 chr ENSMUST00000145158 l18 e 8 nr 5000000 chr ENSMUST00000145278 l18 e 8 nr 5500000 chr ENSMUST00000124268 l18 e 8 nr 6000000 chr ENSMUST00000162328 l18 e 8 nr 6500000 chr ENSMUST00000123678 l18 e 8 nr 7000000 chr ENSMUST00000120938 l18 e 8 nr 7500000 chr ENSMUST00000155268 l18 e 8 nr 8000000 chr ENSMUST00000160528 l18 e 8 nr 8500000 chr ENSMUST00000142878 l18 e 8 nr 9000000 chr ENSMUST00000139148 l18 e 8 nr 9500000 chr ENSMUST00000117988 l18 e 8 nr 10000000 chr ENSMUST00000152158 l18 e 8 nr 10500000 chr ENSMUST00000136448 l18 e 8 nr 11000000 chr ENSMUST00000126468 l18 e 8 nr 11500000 chr ENSMUST00000149348 l18 e 8 nr 12000000 chr ENSMUST00000119218 l18 e 8 nr 12500000 chr ENSMUST00000140608 l18 e 8 nr 13000000 chr ENSMUST00000144568 l18 e 8 nr 13500000 chr ENSMUST00000161498 l18 e 8 nr 14000000 chr ENSMUST00000142678 l18 e 8 nr 14500000 chr ENSMUST00000170778 l18 e 8 nr 15000000 chr ENSMUST00000159458 l18 e 8 nr 15500000 chr ENSMUST00000158038 l18 e 8 Done Creating Read Groups & Clusters...Done Sorting Groups...Done Generating Output...Done! I identified a total of 3929452 reads mapping to 1191316 Unique genomic coordinates Making up 14294 groups Consisting of 10182 clusters Running PARalyzer v1.1 Parsing bowtie file(s)...nr 500000 chr ENSMUST00000132809 l18 e 9 nr 1000000 chr ENSMUST00000132629 l18 e 9 nr 1500000 chr ENSMUST00000148759 l18 e 9 nr 2000000 chr ENSMUST00000137819 l18 e 9 nr 2500000 chr ENSMUST00000155089 l18 e 9 nr 3000000 chr ENSMUST00000173969 l18 e 9 nr 3500000 chr ENSMUST00000160089 l18 e 9 nr 4000000 chr ENSMUST00000128889 l18 e 9 nr 4500000 chr ENSMUST00000134849 l18 e 9 nr 5000000 chr ENSMUST00000123009 l18 e 9 nr 5500000 chr ENSMUST00000124229 l18 e 9 nr 6000000 chr ENSMUST00000152599 l18 e 9 nr 6500000 chr ENSMUST00000155979 l18 e 9 nr 7000000 chr ENSMUST00000154649 l18 e 9 nr 7500000 chr ENSMUST00000124469 l18 e 9 nr 8000000 chr ENSMUST00000142059 l18 e 9 nr 8500000 chr ENSMUST00000119019 l18 e 9 nr 9000000 chr ENSMUST00000138469 l18 e 9 nr 9500000 chr ENSMUST00000156829 l18 e 9 nr 10000000 chr ENSMUST00000169009 l18 e 9 nr 10500000 chr ENSMUST00000127229 l18 e 9 nr 11000000 chr ENSMUST00000154429 l18 e 9 nr 11500000 chr ENSMUST00000136639 l18 e 9 Done Creating Read Groups & Clusters...Done Sorting Groups...Done Generating Output...Done! I identified a total of 2993532 reads mapping to 1176593 Unique genomic coordinates Making up 14466 groups Consisting of 10347 clusters