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I identified a total of 1429567 reads mapping to 615340 Unique genomic coordinates Making up 15968 groups Consisting of 5307 clusters Running PARalyzer v1.1 Parsing bowtie file(s)...nr 500000 chr ENSMUST00000070989 l18 e 9 nr 1000000 chr ENSMUST00000070119 l18 e 9 nr 1500000 chr ENSMUST00000092639 l18 e 9 nr 2000000 chr ENSMUST00000075829 l18 e 9 nr 2500000 chr ENSMUST00000020759 l18 e 9 nr 3000000 chr ENSMUST00000150989 l18 e 9 nr 3500000 chr ENSMUST00000103109 l18 e 9 nr 4000000 chr ENSMUST00000057859 l18 e 9 nr 4500000 chr ENSMUST00000091609 l18 e 9 nr 5000000 chr ENSMUST00000043349 l18 e 9 nr 5500000 chr ENSMUST00000062789 l18 e 9 nr 6000000 chr ENSMUST00000058749 l18 e 9 nr 6500000 chr ENSMUST00000114489 l18 e 9 nr 7000000 chr ENSMUST00000024739 l18 e 9 nr 7500000 chr ENSMUST00000036229 l18 e 9 nr 8000000 chr ENSMUST00000102939 l18 e 9 nr 8500000 chr ENSMUST00000129749 l18 e 9 nr 9000000 chr ENSMUST00000029369 l18 e 9 nr 9500000 chr ENSMUST00000030179 l18 e 9 nr 10000000 chr ENSMUST00000030339 l18 e 9 nr 10500000 chr ENSMUST00000112849 l18 e 9 nr 11000000 chr ENSMUST00000113249 l18 e 9 nr 11500000 chr ENSMUST00000068829 l18 e 9 nr 12000000 chr ENSMUST00000043609 l18 e 9 nr 12500000 chr ENSMUST00000093139 l18 e 9 nr 13000000 chr ENSMUST00000149089 l18 e 9 nr 13500000 chr ENSMUST00000039359 l18 e 9 Done Creating Read Groups & Clusters...Done Sorting Groups...Done Generating Output...Done! I identified a total of 1442145 reads mapping to 604840 Unique genomic coordinates Making up 15607 groups Consisting of 5127 clusters