a.sh
a.sh~
b.sh
b.sh~
foo
KO_0h_replicate_II
KO_2h_replicate_I
KO_2h_replicate_II
KO_6h_replicate_I
KO_6h_replicate_II
KO_IFN-gamma_replicate_II
KO_IFN_replicate_I
KO_IL4_replicate_I
KO_IL4_replicate_II
tophat-calls.log1
tophat-calls.log2
tophat-calls.sh
tophat-calls.sh~
wt0hrep1b
wt0hrep1d
wt0hrep1d-fr-1st
wt0hrep1d-fr-2nd
WT_0h_replicate_II
WT_2h_replicate_I
WT_2h_replicate_II
WT_6h_replicate_I
WT_6h_replicate_II
WT_IFN-gamma_replicate_I
WT_IFN-gamma_replicate_II
WT_IL4_replicate_I
WT_IL4_replicate_II
ΚΟ_0h_replicate_I